转录和免疫反应调节因子;TCIM

染色体 8 开放解读码组 4; C8ORF4
甲状腺癌1;TC1

HGNC 批准基因符号:TCIM

细胞遗传学定位:8p11.21 基因组坐标(GRCh38):8:40,153,482-40,155,310(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Chua等人(2000)通过甲状腺乳头状癌与周围正常甲状腺组织的消减杂交获得了部分cDNA,并将其命名为TC1。通过5-prime RACE和引物延伸分析,他们获得了全长TC1 cDNA,其编码推导的106个氨基酸的蛋白质,计算分子量约为12 kD。Northern 印迹分析在几种甲状腺癌中检测到 1.4 kb 的转录本。RNA斑点印迹分析揭示了所有检查组织中的表达,其中脑、胸腺和白细胞中的表达水平相对较低。

▼ 基因功能

Chua等人(2000)通过Northern印迹分析和RT-PCR发现TC1在16种甲状腺癌中的15种中表达上调。

Yang等(2006)通过阵列CGH分析了22个人类乳腺癌(114480)个标本和7个乳腺癌细胞系中8p12-p11扩增子中基因的拷贝数和表达水平。在鉴定的21个潜在基因中,PCR分析和功能分析表明,LSM1(607281)、BAG4(603884)和C8ORF4这3个基因是乳腺癌癌基因,它们可以联合作用影响人乳腺上皮细胞的转化表型。

Kim 等人(2009)证明了 TC1 在内皮细胞中表达,但在单核细胞系中不表达。瞬时表达导致细胞因子上调,例如IL1A(147760)和IL6(147620);趋化因子,如CCL5(187011)、CXCL1(155730)、IL8(146930);以及粘附分子VCAM1(192225)和ICAM1(147840)。TC1 的敲低会导致这些基因的下调。TC1 表达增强单核细胞-内皮细胞粘附并增加内皮细胞通透性。TC1的表达是NFKB(164011)依赖性的,增强NFKB核转位和DNA结合。Kim等(2009)认为TC1是一种内皮炎症调节因子,可能参与炎症性血管疾病。

▼ 基因结构

Chua et al.(2000)确定TC1基因含有单个外显子。启动子区域包含 TATA 框样序列和核转录因子 Y(参见 189903)和 CCAAT/增强子结合蛋白(参见 116897)的结合位点。

▼ 测绘

Chua等(2000)通过FISH将TC1基因定位到染色体8p11.2。

▼ 动物模型

Kim等人(2009)表明,高度保守的TC1蛋白在斑马鱼的血管造血系统中表达,当过度表达时,会导致水肿。

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