冷激域包含蛋白 C2; CSDC2
PIPPIN
HGNC 批准的基因符号:CSDC2
细胞遗传学定位:22q13.2 基因组坐标(GRCh38):22:41,561,010-41,576,666(来自 NCBI)
▼ 说明
CSDC2被预测为RNA结合蛋白(Castiglia et al., 1996;雷蒙迪等人,2003)。
▼ 克隆与表达
Castiglia等人(1996)克隆了大鼠Csdc2,他们将其命名为Pippin。推导的 154 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 17 kD。Pippin 是亲水性的,并具有 2 个预测的双链 RNA 结合基序。Northern 印迹分析在成年和胚胎大鼠脑中检测到 2.5 kb Pippin 转录物,但在成年大鼠肝脏、脾脏、肾脏或肌肉中未检测到。
Raimondi et al.(2003)报道,冷休克结构域将大鼠 Pippin 的 2 个 RNA 结合基序分开。
▼ 基因功能
Castiglia等人(1996)表明大鼠脑Pippin结合了组蛋白变体H3.3的mRNA(见601128)。
Raimondi等人(2003)通过对重组大鼠Pippin的截短分析发现,只有具有RNA结合基序和中间冷休克结构域的全长蛋白才能与组蛋白mRNA结合。
通过计算机分析,Place et al.(2008)鉴定出了假定的miR373(MIR373; 611954)E-钙粘蛋白(CDH1;611954)启动子区靶位点 192090)和CSDC2基因。将 miR373 及其前体发夹转染至 PC-3 人前列腺癌细胞中,诱导 E-钙粘蛋白和 CSDC2 的表达。敲除实验证实,pre-miR373 诱导 E-cadherin 需要 miRNA 加工酶 Dicer(606241)。转染 miR373 后,在 E-cadherin 和 CSDC3 启动子处均检测到 RNA 聚合酶 II 的富集(参见 180660)。在不同组织来源的其他几种人类细胞系中没有观察到 miR373 对 E-钙粘蛋白和 CSDC2 的诱导,表明 miR373 在不同细胞系中差异激活靶基因。
▼ 测绘
Hartz(2017)根据CSDC2序列(GenBank AB027011)与基因组序列(GRCh38)的比对,将CSDC2基因定位到染色体22q13.2。