溶质载体家族35(3-磷酸腺苷5-磷酸磷酸转运蛋白),成员B2;SLC35B2

3-磷酸​​腺苷5-磷酸磷酸转运蛋白1;PAPST1
PAPS TRANSPORTER 1
SLALOM,果蝇,同源物; SLL

HGNC 批准的基因符号:SLC35B2

细胞遗传学定位:6p21.1 基因组坐标(GRCh38):6:44,254,101-44,257,890(来自 NCBI)

▼ 说明

磺基转移酶(如SULT4A1;608359)使用硫酸盐的活化形式,3-磷酸腺苷5-磷酸硫酸盐(PAPS)作为常见的硫酸盐供体,用于内质网和高尔基体中糖蛋白、蛋白聚糖和糖脂的硫酸化。SLC35B2 位于微粒体膜中,将 PAPS 从合成的细胞质转运至高尔基体腔(Kamiyama et al., 2003)。

▼ 克隆与表达

通过数据库分析和结肠cDNA文库的PCR,Kamiyama等人(2003)克隆了SLC35B2,他们将其命名为PAPST1。推导的 432 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 47.5 kD。PAPST1是一种具有8个跨膜结构域的III型跨膜蛋白。实时 PCR 检测到胎盘中 PAPST1 表达最高,其次是胰腺、乳腺和骨骼肌。除结肠、心脏和前列腺外,在所有其他检查组织中均检测到中等表达,这些组织的表达较弱。免疫荧光显微镜和细胞分级分离将表位标记的 PAPST1 定位到转染的人类细胞系的高尔基膜上。

Guasto 等人(2022)利用 qPCR 研究了人脑样本中的 SLC35B2 mRNA 表达,发现整个大脑都有“良好”的表达,最突出的是额叶灰质、皮质下额叶白质和小脑。作者指出,小鼠大脑单细胞 RNA 数据还显示少突胶质细胞和小胶质细胞中 Slc35b2 mRNA 高表达。

▼ 基因结构

Kamiyama等人(2003)确定SLC35B2基因至少含有4个外显子。

▼ 测绘

Kamiyama等人(2003)通过基因组序列分析,将SLC35B2基因定位到染色体6。

Gross(2023)根据SLC35B2序列(GenBank BC024288)与基因组序列(GRCh38)的比对,将SLC35B2基因定位到染色体6p21.1。

▼ 基因功能

Kamiyama等人(2003)发现表达人PAPST1的酵母细胞膜部分的PAPS转运活性比表达模拟转染子的细胞膜部分高4.3倍。

通过 HeLa 细胞的敲除筛选,Guo 等(2022)鉴定出 SLC35B2、SCARB2(602257)和 B3GAT3(606374)是促进肠道病毒 71(EV71)感染的宿主因子。敲除SCARB2、SLC35B2或B3GAT3可对EV71感染提供强有力的保护,而重新引入SCARB2、SLC35B2或B3GAT3可恢复敲除细胞中EV71的感染性。病毒结合和内化测定表明,SLC35B2 和 B3GAT3 对于病毒进入中 EV71 的附着和内化至关重要。SCARB2 在附着和内化中发挥相对较小的作用,但它似乎在病毒脱壳步骤中发挥至关重要的作用。进一步分析表明,宿主硫酸化对于 EV71 进入至关重要,并且 SLC35B2 可以充当宿主硫酸化的重要调节剂。硫酸乙酰肝素在 EV71 感染中发挥重要作用,一些酪氨酸硫酸化蛋白也参与其中。作为支持,SCARB2被发现在多个酪氨酸残基处被硫酸化,并且其酪氨酸硫酸化对于EV71感染至关重要。

▼ 分子遗传学

2名无血缘关系的女孩患有低髓鞘性脑白质营养不良和软骨发育不良(HLD26; 620269),Guasto et al.(2022)鉴定了SLC35B2基因突变的纯合性:第一位患者是一名12岁的摩洛哥女孩,她的框内3-bp缺失是纯合的(610788.0001),第二位患者是纯合的。是一位8岁的西班牙女孩,她是2-bp缺失纯合子(610788.0002)。这些突变在每个家族中与疾病完全分离,并且在公共变异数据库中没有发现。功能分析显示,与野生型 SLC35B2 相比,突变蛋白的表达显着降低,并且部分错误定位。

▼ 动物模型

Kamiyama等人(2003)发现,RNA干扰介导的slalom(sll)(人类PAPST1的果蝇同源物)的敲除可导致蛹死亡。

▼ 等位基因变异体(2个精选例子):

.0001 脑白质营养不良,髓鞘形成低下,26 ,伴有软骨发育不良

SLC35B2,3-BP DEL,NT1218

一名12岁摩洛哥女孩(患者1)患有低髓鞘性脑白质营养不良和软骨发育不良(HLD26;620269),Guasto et al.(2022)鉴定了SLC35B2基因外显子4中3-bp框内缺失(c.1218_1220del,NM_178148.3)的纯合性,导致密码子407处高度保守的亮氨酸残基缺失(Leu407del)位于推定的蛋白质转运蛋白结构域内。她未受影响的表亲父母和 2 个未受影响的姐妹为杂合性删除,在 dbSNP、ExAC 或 gnomAD 数据库中未发现该删除。与对照成纤维细胞相比,患者成纤维细胞的 RT-PCR 显示 SLC35B2 mRNA 显着减少。转染的 HEK293F 细胞的免疫荧光测定表明,野生型 SLC35B2 与高尔基体特异性标记共定位,而突变蛋白显示部分错误定位,细胞内信号弥散。作者指出,该患者还发现 CUL7 基因(609577)中的 R1062W 替换是纯合子,CUL7 基因是与 3-M 综合征(3M1;3M1;)相关的基因。273750)。

.0002 脑白质营养不良,髓鞘形成低下,26 ,伴有软骨发育不良

SLC35B2,2-BP DEL,1224AG

一名8岁西班牙女孩(患者2)患有低髓鞘性脑白质营养不良和软骨发育不良(HLD26;620269),Guasto 等人(2022)鉴定出 SLC35B2 基因外显子 4 中 2 bp 缺失(c.1224_1225delAG, NM_178148.3)的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Arg408SerfsTer18)。该缺失在 dbSNP、ExAC 或 gnomAD 数据库中未发现,是遗传自她未受影响的母亲,在她的父亲中未发现;进一步的分析揭示了跨越所有染色体 6 的单亲二倍体。与对照成纤维细胞相比,患者成纤维细胞的 RT-PCR 显示 SLC35B2 mRNA 显着减少。转染的 HEK293F 细胞的免疫荧光测定表明,野生型 SLC35B2 与高尔基体特异性标记共定位,而突变蛋白显示部分错误定位,细胞内信号弥散。

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