DIS3 样外泌体 3-PRIME-5-PRIME 外核糖核酸酶;DIS3L

DIS3 有丝分裂控制,酿酒酵母,同源样
DIS3 样核酸外切酶 1;DIS3L1
KIAA1955

HGNC 批准的基因符号:DIS3L

细胞遗传学定位:15q22.31 基因组坐标(GRCh38):15:66,293,309-66,333,898(来自 NCBI)

▼ 说明

RNA 外泌体是一种大约 400 kD 的多聚核糖核酸复合物,参与 RNA 加工和多种 RNA 底物降解中的核酸内切和 3-prime/5-prime 外切核酸活性。DIS3L 是一种催化子单元,具有 3-prime/5-prime 核酸外切活性(Tomecki 等人总结,2010)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人(2001)通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,克隆了 DIS3L,并将其命名为 KIAA1955。转录本的3-prime末端含有重复元件,推导的947个氨基酸的蛋白质与DIS3(607533)有36%的同一性。RT-PCR ELISA 检测到骨骼肌中表达最高。在所有其他成人和胎儿组织以及所检查的特定成人大脑区域中检测到中度至高表达。

Tomecki et al.(2010)通过在人类 EST 数据库中搜索与酵母 Dis3 相似的序列,鉴定出了 DIS3L。推导的 1,000 个氨基酸蛋白包含一个弱的 N 端 PIN 样结构域,随后是 2 个冷休克结构域、一个 RNB 核酸外切酶催化结构域和一个 C 端 S1 结构域。DIS3L 主要定位于 HEK293 和 HeLa 细胞的细胞质,排除核仁。

Staals等人(2010)通过分析从HeLa细胞中免疫亲和纯化的外泌体复合物相关肽,然后进行数据库分析和畸胎癌cDNA文库的PCR分析,克隆了全长DIS3L,并将其命名为DIS3L1。推导的 1,054 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 120.8 kD。它有一个保守性较差的 N 端 PIN 结构域,后面是 2 个冷休克结构域、一个推定的 RNase II 型 RNB 核酸外切酶催化结构域和一个可能的 C 端 S1 RNA 结合结构域。数据库分析揭示了 3 个额外的 DIS3L1 剪接变体。荧光和表位标记的 DIS3L1 和内源性 DIS3L1 定位于转染的人 HEP-2 细胞的细胞质。

▼ 基因功能

Staals et al.(2010)证实荧光或表位标记的DIS3L1与RRP4(EXOSC2;602238)和其他外泌体成分。免疫纯化的DIS3L1显示出Mg(2+)依赖性核糖核酸外切酶活性,并将底物RNA转化为单磷酸核苷酸。它没有核酸内切酶活性。阻断 3-prime 末端会损害降解,与 3-prime/5-prime 外切核糖核酸酶活性一致。小干扰 RNA 介导的 DIS3L1 消耗降低了免疫纯化外泌体的外核糖核酸酶活性。DIS3L1 RNB 结构域内的 asp486 突变消除了其核糖核酸酶活性,并导致截短的 28S rRNA 片段的积累。

Tomecki et al.(2010)发现表位标记的人DIS3或DIS3L与来自转染的HEK293细胞的核心外泌体子单元共免疫沉淀。HeLa 细胞中 DIS3L 的缺失对核 RNA 的积累没有影响,但有助于通过敲低 DIS3 诱导的细胞质 MYC(190080)的稳定。从转染的 HEK293 细胞中纯化的 DIS3L 显示出针对单链 RNA 的 3-prime/5-prime 核酸外切酶活性,但没有显示出针对环状 RNA 底物的核酸内切酶活性。结构域分析表明 DIS3L 的 RNB 结构域赋予核酸外切酶活性。

▼ 测绘

Hartz(2011)根据DIS3L序列(GenBank AB075835)与基因组序列(GRCh37)的比对,将DIS3L基因定位到染色体15q22.31。

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