TOX 高机动性组箱家庭成员 3; TOX3

含有 9 个重复三核苷酸； TNRC9
CAGF9

HGNC 批准的基因符号：TOX3

细胞遗传学位置：16q12.1 基因组坐标（GRCh38）：16:52,436,416-52,547,802（来自 NCBI）

▼ 说明

TOX3 属于庞大且多样化的 HMG框 蛋白家族，其在通过弯曲和展开 DNA 来修饰染色质结构中充当结构因子（O'Flaherty 和 Kaye，2003）。

▼ 克隆与表达

通过数据库搜索小鼠 Tox3 的人类同源物，O'Flaherty 和 Kaye（2003） 鉴定了 TOX3，他们将其称为 TNRC9。推导的 576 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 63.3 kD。它的中央有一个富含赖氨酸的核定位信号，后面跟着一个 HMG 框。 TOX3 与小鼠 Tox3 蛋白具有高度相似性，但 C 末端编码谷氨酰胺的三核苷酸重复序列在小鼠中未发现。

▼ 基因功能

斯密德等人（2006） 发现 TNRC9 是 69 个基因之一，这些基因在经历乳腺癌骨复发的患者与经历身体其他部位复发的患者中存在差异表达。

▼ 测绘

O'Flaherty 和 Kaye（2003） 指出，小鼠 Tox3 对应到与人类 16 号染色体共享同线同源性的 8 号染色体区域（2007） 指出 TNRC9 基因对应到染色体 16q12。

▼ 分子遗传学

Antoniou 等人在 23 项研究的 10,358 名 BRCA1（113705） 或 BRCA2（600185） 基因突变携带者样本中（2008） 观察到乳腺癌与 TNRC9 基因中 rs3803662 的次要等位基因之间存在显着的联合关联（每个等位基因风险比为 1.13，p（trend） = 5 x 10（-5））。作者得出结论，该基因座与 BRCA1 或 BRCA2 突变携带者的乳腺癌风险呈倍数相互作用。

奥尔等人（2012） 进行了一项男性乳腺癌全基因组关联研究（参见 114480），其中包括欧洲血统的 823 例病例和 2,795 名对照，并在总计 438 例病例和 474 名对照的孤立样本集中进行了验证。奥尔等人（2012） TOX3 内 16q12.1 与 rs3803662 的精细关联（P = 3.87 x 10（-15）；OR = 1.50；95% 置信区间 1.35-1.66）。

Cowper-Sal-lari 等人采用了一种结合顺反组学、表观基因组学和基因型插补的新方法（2012） 注释了乳腺癌细胞基因组的非编码区域，并系统地鉴定了与乳腺癌风险相关的 SNP 的功能性质。他们的结果表明，乳腺癌风险相关的 SNP 以癌症和细胞类型特异性的方式富集在 FOXA1（602294） 和 ESR1（133430） 的顺反子以及组蛋白 H3 赖氨酸 4 单甲基化（H3K4me1） 的表观基因组中。此外，大多数与风险相关的 SNP 在远端调控元件处调节染色质对 FOXA1 的亲和力，从而导致等位基因特异性基因表达，16q12.1 内 TOX3 基因中 rs4784227 SNP 的影响就是例证。风险位点。