副肿瘤 MA 抗原家族,成员 5; PNMA5
副肿瘤抗原样蛋白 5
KIAA1934
HGNC 批准的基因符号:PNMA5
细胞遗传学位置:Xq28 基因组坐标(GRCh38):X:152,988,824-152,994,116(来自 NCBI)
▼ 说明
PNMA5 似乎参与灵长类新皮质关联区域的特化(Takaji 等人,2009)。
▼ 克隆与表达
通过筛选主要在大脑中表达的大基因,Nagase 等人(2001) 分离出编码 PNMA5 的胎儿大脑 cDNA,他们将其称为 KIAA1934。预测的蛋白质含有452个氨基酸。 RT-PCR ELISA 仅在睾丸以及成人和胎儿脑中检测到显着的 PNMA5 表达。在脑内,杏仁核、尾状核、海马、黑质和丘脑底核中检测到显着的 PNMA5 表达。
通过在数据库中搜索 PNMA1(604010) 的同源物,Schuller 等人(2005) 鉴定出人类 PNMA5。预测的蛋白质包含 448 或 452 个氨基酸,具体取决于所使用的起始密码子,并且与其他 PNMA 蛋白质具有 40 至 45% 的同源性。人PNMA5与小鼠蛋白有53%同源性。
Takaji 等人通过使用从猕猴大脑 4 个不同皮质区域纯化的 mRNA 进行限制性标志物 cDNA 扫描,然后进行序列分析和 RT-PCR(2009) 发现 Pnma5 与新皮质的额叶和颞叶区域相关,但与视觉区域无关。原位杂交分析还显示,与皮质下猕猴大脑相比,皮质中 Pnma5 的表达更高。 Pnma5 表达主要发生在兴奋性神经元和也表达视黄醇结合蛋白(RBP;参见 180260)的脑组织中。狨猴(一种新大陆猴类)的表达模式相似。高二等人(2009) 报道人类 PNMA5 与非洲绿猴蛋白有大约 94% 的氨基酸同一性。对非洲绿猴组织的 Northern 印迹分析显示,Pnma5 表达仅限于新皮质,特别是颞区和睾丸。在啮齿动物中,Pnma5 表达仅在睾丸中检测到。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Nagase 等人(2001) 将 PNMA5 基因定位到 X 染色体。
Gross(2014) 根据 PNMA5 序列(GenBank BC101111) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 PNMA5 基因对应到染色体 Xq28。