含 CAP-GLY 结构域的连接蛋白 1; CLIP1
RESTIN; RSN
REED-STNBERG 微管相关蛋白
细胞质接头1; CYLN1
细胞质连接蛋白 170;CLIP170
HGNC 批准的基因符号:CLIP1
细胞遗传学位置:12q24.31 基因组坐标(GRCh38):12:122,271,469-122,422,956(来自 NCBI)
▼ 说明
CLIP1 编码微管(MT) 加端跟踪蛋白家族的成员。它在精子发生和神经元发育中发挥着重要作用(Larti 等人总结,2015)。
▼ 克隆与表达
内吞载体囊泡与微管的结合在体外取决于微管结合蛋白 CLIP170。在体内,CLIP170 与转铁蛋白受体阳性内吞结构的子集共定位,更广泛地,与布雷菲德菌素 A. Pierre 等人诱导的内体小管共定位(1992) 克隆了 CLIP70 的 cDNA,发现预测的蛋白质含有 1,392 个氨基酸。预测的同二聚体蛋白的非螺旋 C 端和 N 端结构域通过长卷曲螺旋结构域连接。皮埃尔等人(1992) 鉴定了 CLIP170 N 端结构域串联重复中存在的一个新基序,该基序参与与微管的结合。该基序也存在于果蝇 Glued 和酵母 BIK1 蛋白中。这些特征及其非常细长的结构表明 CLIP170 属于一类新型蛋白质,称为细胞质连接蛋白(CLIP),可介导细胞器与微管的相互作用。
Restin 最初被认为是一种中间丝相关蛋白,实际上如免疫荧光显微镜所示与微管相关(Pierre 等,1994)。其表达仅限于 Reed-Sternberg 细胞(霍奇金病的特征)和体外培养的外周血单核细胞(Bilbe 等,1992;Delabie 等,1992)。 Bilbe 等人将该蛋白命名为 Restin(1992) 因为它在 Reed-Sternberg 细胞中的特异性表达。比尔贝等人(1992)表明其过度表达可能是霍奇金病进展的一个促成因素。德拉比等人(1992) 发现在正常组织、一系列 B 细胞和 T 细胞非霍奇金淋巴瘤和非淋巴肿瘤中检测不到 Restin。 Restin存在于霍奇金病的Reed-Sternberg细胞及其变体中,但以淋巴细胞为主的副肉芽肿亚型除外。伊尔施等人(1998)描述了从霍奇金病组织中分离出活的单核霍奇金细胞和里德-斯滕伯格细胞以及双核或寡核里德-斯滕伯格细胞。
CLIP170 和 Restin 完全相同,只是 Restin 中插入了 CLIP170 中不存在的 35 个氨基酸。 Griparic 和 Keller(1998) 鉴定了 CLIP170 的 2 个变体:CLIP170(11),它包含 11 个氨基酸插入片段,而不是 35 个氨基酸 Restin 插入片段;CLIP170(11+35),它同时包含 11 个氨基酸片段酸插入物和 35 个氨基酸 Restin 插入物。发现两种新亚型优先在肌肉组织中表达。
▼ 基因功能
佩雷斯等人(1999) 发现 CLIP170 沿着微管末端的一个子集延伸结合。这些拉伸似乎随着微管尖端的生长以 0.15 至 0.4 微米/秒的速度移动,与体内微管伸长相当。对沿动态 CLIP170 延伸的斑点的分析表明,CLIP170 跑步机位于不断生长的微管末端,而不是连续向这些末端输送。影响微管动力学的药物迅速抑制 CLIP170 划线的运动。佩雷斯等人(1999) 提出 CLIP170 通过特异性识别新聚合的微管蛋白片段的结构来突出生长的微管末端。
深田等人(2002) 发现 IQGAP1(603379)(RAC1(602048) 和 CDC42(116952) 的效应子)与 CLIP170 相互作用。在 Vero 成纤维细胞中,IQGAP1 位于极化前缘。包含 CLIP170 结合区的 IQGAP1 C 末端片段的表达使 GFP-CLIP170 从微管尖端离域并改变了微管阵列。作者发现激活的 RAC1/CDC42、IQGAP1 和 CLIP170 形成三方复合物。此外,RAC1/CDC42 结合缺陷的 IQGAP1 突变体的表达诱导了多个前缘。这些结果表明,RAC1/CDC42 标记了 IQGAP1 和 CLIP170 复合物所针对的特殊皮质点,从而导致极化的微管阵列和细胞极化。
▼ 测绘
Hilliker 等人通过结合染色体 R 带和 2 种荧光染料的荧光原位杂交(1994)同时检测到杂交的DNA序列和染色体R带。通过这种技术,他们将 RSN 基因分配给 12q24.31-q24.33。
▼ 分子遗传学
请参阅 179837.0001,了解智力障碍综合征与 CLIP1 基因变异之间可能存在关联的讨论。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 意义未知的变体
CLIP1、GLN1010TER
该变异被归类为意义不明的变异,因为其对智力障碍综合征的贡献尚未得到证实。
Larti 等人在患有中度智力障碍的伊朗近亲家庭受影响成员中,1 名男性出现癫痫发作、斜视、完全生精发育不全,1 名女性脑部 MRI 出现局灶性脑白质营养不良(2015) 在 CLIP1 基因中发现了一个纯合的 c.3028C-T 转变(c.3028C-T, NM_002956.2),导致 gln1010 到 ter(Q1010X) 的取代,从而与该家族中的疾病分离。 RT-PCR 和蛋白质印迹分析显示,来自受影响患者的类淋巴母细胞中不存在 CLIP1 转录物和蛋白质。免疫荧光分析显示,成纤维细胞中存在 MT plus-end 染色,其中含有野生型 CLIP1 蛋白,但不含有突变型 CLIP1 蛋白。
注:Larti 等人的文章(2015) 指出,作者鉴定了 c.3028C-T CLIP1 变体以及其他“排除的”变体。通过对 1 名受影响家庭成员的基因组 DNA 样本进行高通量测序,发现补充表 1(ST1) 中列出的变体;然而,虽然 ST1 列出了 39 个变体,但该文章的补充信息文件指出“对于这个家族,我们最终得到了 62 个变体的列表,在补充表 ST1 中提供。”