基质细胞衍生因子 2-L样 1; SDF2L1

SDF2-LIKE 1

HGNC 批准的基因符号:SDF2L1

细胞遗传学位置:22q11.21 基因组坐标(GRCh38):22:21,642,302-21,644,299(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

在研究小鼠肝细胞癌细胞中辐射诱导的基因表达时,Fukuda 等人(2001) 分离了一个与 Sdf2(602934) 相似的克隆,并获得了全长小鼠 cDNA。他们使用该 cDNA 作为探针,从人类睾丸 cDNA 文库中克隆了 SDF2L1。推导的人和小鼠蛋白质含有 221 个氨基酸,并且具有 88% 的序列同一性。 SDF2L1 在 N 端具有疏水信号序列,在 C 端具有内质网(ER) 保留样基序(HDEL)。 SDF2 和 SDF2L1 与 POMT1(607423)、POMT2(607439)、酿酒酵母和白色念珠菌的 O-甘露糖基转移酶家族以及果蝇的 rt 蛋白的中央亲水区域显着相似。 Northern blot分析检测到Sdf2l1在小鼠组织中普遍表达,在睾丸、卵巢和子宫中强表达,在心脏和骨骼肌中弱表达。人体组织的 Northern 印迹分析显示,在睾丸中强表达,在胰腺、脾脏、前列腺、小肠和结肠中中度表达,在脑和骨骼肌中低表达。

▼ 基因功能

福田等人(2001) 指出,几种 ER 驻留蛋白是应激蛋白,可增加“未折叠蛋白反应”中的表达。它是通过蛋白质合成或钙稳态的破坏而激活的。他们发现,在用衣霉素(一种 N 连接糖基化抑制剂)或 A23187(一种钙离子载体)处理后,小鼠肝细胞癌细胞系中的 Sdf2l1 上调。热应激会微弱地增加Sdf2l1的表达,而蛋白质合成抑制剂放线菌酮则没有效果。

▼ 基因结构

福田等人(2001) 确定 SDF2L1 基因包含 3 个外显子,跨度约为 2 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,福田等人(2001) 将 SDF2L1 基因定位到染色体 22q11.2。

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