CGG 结合蛋白 1; CGBP1

CGG 结合蛋白,20-KD
p20CGBP

HGNC 批准的基因符号:CGGBP1

细胞遗传学位置:3p11.1 基因组坐标(GRCh38):3:88,051,950-88,149,870(来自 NCBI)

▼ 说明

CGGBP1 通过与 5 素 UTR 中的 5 素(CGG)n-3 素重复序列特异性相互作用,影响与脆性 X 综合征(300624) 相关的 FMR1 基因(309550) 的表达。

▼ 克隆与表达

具有通用结构(CGG)n 的三核苷酸重复的自主扩展与多种人类遗传疾病有关。 FMR1 5-prime UTR 中(CGG)n 重复序列的扩展伴随着重复序列中 CG 二核苷酸的广泛甲基化,并且与 FMR1 基因的转录沉默相关。戴斯勒等人(1996) 鉴定了一种 20 kD HeLa 细胞核蛋白 p20-CGBP(CGG 结合蛋白),它特异性结合双链 CGG 重复序列。 p20-CGBP 结合因结合基序的完全或部分甲基化而受到严重抑制。通过搜索带有p20-CGBP部分蛋白序列的EST数据库,Deissler等人(1997) 鉴定出包含整个 p20-CGBP 编码区的 cDNA。预测的 166 个氨基酸蛋白质包含推定的核定位信号。 Northern 印迹分析显示 p20-CGBP 在 HeLa 细胞中表达为 1.2 kb 转录本。斑点印迹杂交表明该mRNA在许多人体组织中表达。使用 Southern 印迹,Deissler 等人(1997) 发现 p20-CGBP 基因在哺乳动物中是保守的。

瑙曼等人(2004) 鉴定了 CGGBP1 的外显子 3 剪接变体以及几个替代的聚腺苷酸化信号。 Northern 印迹分析检测到在所有成人和胎儿组织中以不同比例表达的 4.5-kb 和 1.2-kb 转录物。最高表达在成人骨骼肌、胸腺和胰腺中。小鼠 Cggbp1 在胚胎干细胞和整个小鼠胚胎发育过程中表达。

▼ 基因功能

瑙曼等人(2004) 确定 CGGBP1 的启动子区域在人类细胞中未甲基化,并且在报告基因测定中体外甲基化使启动子失活。他们发现,CGGBP1 在体外与 n 等于或大于 5 的 5-prime-(CGG)n-3-prime 重复序列结合。它还结合中断的重复序列。

▼ 基因结构

瑙曼等人(2004) 确定 CGGBP 基因包含 4 个外显子,整个开放解读码组位于外显子 4 内。启动子区域包含 CAAT 框和几个 Sp1(189906) 结合位点。

▼ 测绘

通过对体细胞杂交组的分析,Deissler 等人(1997) 将 p20-CGBP 蛋白对应到人类 3 号染色体上。Naumann 等人使用 FISH 技术(2004) 将 CGGBP 基因定位在染色体 3p 上着丝粒附近。

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