磷酸胞苷酰转移酶 1,胆碱,β 亚型; PCYT1B
CCT-β
HGNC 批准的基因符号:PCYT1B
细胞遗传学位置:Xp22.11 基因组坐标(GRCh38):X:24,558,087-24,672,887(来自 NCBI)
▼ 说明
PCYT1B 基因编码 CTP 的 β 亚型:磷酸胆碱胞苷酰转移酶(CCT;EC 2.7.7.15),磷脂酰胆碱生物合成的关键调节因子(Lykidis 等,1998)。
▼ 克隆与表达
通过在 EST 数据库中搜索编码 CCT 样蛋白的 cDNA,Lykidis 等人(1998) 鉴定出 PCYT1B,他们将其称为 CCT-β。推导的 330 个氨基酸蛋白具有与 PCYT1A(123695) 几乎相同的催化核心和螺旋结构域。然而,N 端结构域缺乏 PCYT1A 中发现的核定位基序。 PCYT1B 的 C 端比 PCYT1A 的短,并且只有 3 个丝氨酸,而不是 PCYT1A 的 16 个丝氨酸(潜在的磷酸化位点)。 Northern 印迹分析显示,约 6.5、1.9 和 1.1 kb PCYT1B 转录物普遍表达,这些转录物在睾丸、胎盘、大脑、卵巢和所有测试的胎儿组织中最为丰富。 SDS-PAGE 和免疫印迹分析表明,PCYT1B 表达为 35 kD 和 42 kD 蛋白质,前 26 个氨基酸有明显的后修饰,导致第二种形式的表达。免疫荧光显微镜显示PCYT1B定位于细胞质。
通过搜索 EST 数据库,Lykidis 等人(1999) 鉴定了 PCYT1B 的剪接变体,他们将其称为 CCT-β-2。推导的 CCT-β-2 亚型包含 369 个氨基酸,与之前报道的亚型(Lykidis et al., 1998) CCT-β-1 相同,最多 320 个氨基酸。CCT-β-2 的 C 末端在氨基酸 310 之后有 21 个潜在磷酸化位点,并包括 2 个存在于 CCT-α(PCYT1A) 中但不存在于 CCT-β-1 中的基序。与 CCT-α 一样,CCT-β-2 在体外也高度磷酸化。相比之下,CCT-β-1 显示出低得多的磷酸化。人体组织的 RT-PCR 显示 CCT-β-1 和 CCT-β-2 的不同表达。在检测到两种变体的组织中,CCT-β-1 在肝脏和胎儿肺中占主导地位,CCT-β-2 在脑和 HeLa 细胞中占主导地位。仅 CCT-β-1 在胎盘中表达,两种变体在成人肺中均不表达。 HeLa 细胞、BAC1.2F5 鼠巨噬细胞和 CHO58 仓鼠卵巢细胞的共聚焦显微镜显示,两种 CCT-β 亚型均与内质网相关。莱基迪斯等人(1999) 发现 CCT-β N 末端没有在体内进行后转录修饰,正如之前基于体外转录/转录所建议的那样(Lykidis 等,1998)。
▼ 基因功能
莱基迪斯等人(1998) 发现,与 PCYT1A 一样,PCYT1B 具有依赖于刺激性脂质存在的 CCT 活性。
莱基迪斯等人(1999) 发现 COS-7 细胞中 CCT-β-2 的过度表达显着增加了 CCT 活性。 CCT-α、CCT-β-1 或 CCT-β-2 的过表达可以补充 CHO58 细胞中 CCT 活性的缺陷,表明所有 3 种同工型均具有相同的生化功能。
▼ 测绘
Gross(2015) 根据 PCYT1B 序列(GenBank AF052510) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PCYT1B 基因对应到染色体 Xp22.11。