磷酸二酯酶 6C; PDE6C
磷酸二酯酶 6C、cGMP 专用、CONE、α-PRIME
PDEA2
HGNC 批准的基因符号:PDE6C
细胞遗传学位置:10q23.33 基因组坐标(GRCh38):10:93,612,537-93,666,010(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
在视网膜视杆细胞中,磷酸二酯酶(PDE)由一个 88-kD α 子单元(180071)、一个 84-kD β 子单元(180072)和两个 11-kD γ 子单元(180073)组成,而在视锥细胞中,磷酸二酯酶(PDE)由作为两个 94-kD α-prime 子单元(PDE6C) 的同二聚体出现,这两个 94-kD α-prime 子单元(PDE6C) 与 3 个较小的 11、13 和 15 kD 蛋白质相关。 11-和 13-kD 蛋白质与 rod γ 子单元相似,而 15-kD δ 子单元则与锥体和杆状 PDE 结合。李等人(1990) 使用杆状 cGMP PDE α 子单元的一部分作为探针,从视网膜 cDNA 文库中克隆了牛视锥光感受器 cGMP 磷酸二酯酶 α-prime 子单元(他们称之为 PDEA2)。
皮里耶夫等人(1995) 表明人类 PDEA2 基因编码一个 858 个氨基酸的蛋白质,与牛序列有 93% 的一致性。该蛋白含有 2 个 cGMP 结合域和一个 C 端催化域。
费先科等人(1996)同样报道了完整的cDNA序列。它的长度为 3,455 bp,编码 858 个氨基酸的多肽,计算分子量为 99,169 Da。推导的氨基酸序列与牛、人、鸡和小鼠光感受器 PDE 的 α、β 和 α-prime 子单元具有高度同源性。
▼ 基因结构
皮里耶夫等人(1995) 表明人类 PDEA2 基因由 22 个外显子组成,横跨约 48 kb 的基因组 DNA。人类 PDE6C 的内含子-外显子结构与视杆细胞 PDE6B(180072) 的内含子-外显子结构非常相似,表明其进化历史最近。
▼ 测绘
皮里耶夫等人(1995)通过荧光原位杂交将PDE6C基因定位到10q24。
▼ 分子遗传学
蒂亚登斯等人(2009) 在 4 个患有早发性视锥细胞感光障碍的家庭的受影响成员中鉴定出 PDE6C 基因(600827.0001-600827.0006) 的纯合和复合杂合突变,范围从早发性视锥细胞营养不良(COD4; 613093) 到完全色盲(ACHM5;参见 613093)。两名年龄最大的突变阳性患者(年龄分别为 47 岁和 51 岁)的视网膜电图(ERG) 分析显示,视锥细胞反应缺失,但视杆细胞反应无异常,在 3 名完全色盲患者中也观察到正常的视杆细胞反应。蒂亚登斯等人(2009) 的结论是,视杆细胞受累似乎并不是 PDE6C 突变的主要后果,尽管他们指出,视杆细胞的某些功能障碍可能在以后的生活中仍可能发生。
Chang 等人在 2 个家庭的受累成员和 2 名散发性全色盲患者中发现了 5 例(2009) 鉴定了 PDE6C 基因突变的纯合性或复合杂合性(分别为 600827.0007-600827.0013)。
▼ 动物模型
Chang 等人在缺乏视锥细胞功能并表现出视锥光感受器快速退化的 cpfl1 小鼠中(2009)进行连锁分析并鉴定出包含候选基因Pde6c的0.7-cM区间。比较 cDNA 分析显示,突变小鼠的 Pde6c 基因中存在 116 bp 插入和 1 bp 缺失;预计这两种突变都会引入提前终止密码子。 3周龄时,cpfl1小鼠的ERG表现出正常的暗适应反应,而代表视锥细胞功能的光适应反应几乎不存在。视网膜组织学显示其形态和分层基本正常,但早在 3 周龄时,感光层中的一小部分细胞就出现空泡化,随后视锥细胞迅速、逐渐耗尽。此外,Chang 等人(2009) 观察到内核层中的细胞核肿胀和固缩;视锥细胞的丧失不断进展,以至于在 5 个月大的 cpfl1 小鼠的视网膜切片中只能检测到很少的视锥细胞。
莫希里等人(2019) 报道了 4 只视力受损的恒河猴,它们表现出与人类状况几乎相同的全色盲迹象。所有 4 只猴子在 Pde6c 中的 arg565-to-gln(R565Q) 突变都是纯合的,该突变改变了酶催化结构域中的保守残基,特别是在对环核苷酸水解至关重要的第一个金属结合基序内。受影响的恒河猴的父母都是杂合的突变,而多个未受影响的同胞是杂合的或没有突变。在转染的 HEK293T 细胞中,具有 R565Q 突变的 Pde6c 显示出正常定位,但与野生型相比,酶活性显着降低。
▼ 等位基因变异体(14 个选定示例):
.0001 锥体营养不良 4
色盲 5,包含
PDE6C、ARG29TRP
视锥细胞营养不良 4
Thiadens 等人在 2 名患有早发性视锥细胞营养不良(COD4; 613093) 的兄弟中(2009) 鉴定了 PDE6C 基因外显子 1 中 85C-T 转变的纯合性,导致第一个 GAF 结构域上游的保守残基处发生 arg29 到 trp(R29W) 的取代。在 180 个种族匹配的对照中没有发现这种突变。兄弟俩分别在 6 岁和 7 岁时首次检查时,患有严重的色觉缺陷,ERG 上的视锥细胞反应降低;他们还患有畏光和眼球震颤,青少年时期视力逐渐下降。分别在 51 岁和 47 岁时进行的 ERG 检查显示没有视锥细胞反应,而视杆细胞反应正常。
全色盲 5
在一名诊断为全色盲(ACHM5;参见 613093)的患者(患者 15)中,Weisschuh 等人(2018) 鉴定了 PDE6C 基因中 R29W 突变(c.85C-T, NM_006204.3) 和 c.836T-C 转变的复合杂合性,导致 ile279 到 thr(I279T; 600827.0014) 的替换GAF 域。
.0002 色盲 5
PDE6C、TYR323ASN
Thiadens 等人在一对患有不完全色盲(ACHM5;见 613093)的姐妹和兄弟中,由近亲父母出生(2009) 鉴定了 PDE6C 基因外显子 6 中 967T-A 颠换的纯合性,导致第二个 GAF 结构域内完全保守的残基处由 tyr323 替换为 asn(Y323N)。父母都是杂合突变,而在 180 个种族匹配的对照中没有发现这种突变。两名同胞分别在 7 岁和 10 岁时初次检查时有眼球震颤,但没有畏光,他们最好的眼睛的初始视力为 0.16(20/100),在接下来的十年中下降到 0.10(20/200)。弟弟在 10 岁和 20 岁时,在 ERG 检查中显示出明显降低但可测量的视锥反应,视杆参数正常。
.0003 色盲 5
PDE6C、2-BP DUP、257AG
Thiadens 等人在一名患有完全色盲(ACHM5;参见 613093)的 4 岁男孩中(2009) 鉴定了 PDE6C 基因外显子 1 中 2-bp 重复(257dupAG) 的复合杂合性,预计会导致提前终止,以及内含子 20 中的 5-bp 缺失(2367+1delGTAAG; 600827.0004),从而去除了剪接供体位点,预计会导致使用替代剪接位点,从而导致移码和蛋白质过早终止。在 180 个种族匹配的对照中没有发现这些突变。 4岁时,患者视力为0.10(20/200),有严重畏光和眼球震颤; ERG 显示不可记录的视锥细胞功能,但视杆细胞功能完全正常。
.0004 色盲 5
PDE6C、5-BP DEL、2367+1GTAAG
关于 Thiadens 等人在完全色盲患者(ACHM5;参见 613093) 复合杂合状态下发现的 PDE6C 基因(2367+1delGTAAG) 中 5-bp 缺失的讨论(2009),参见 600827.0003。
.0005 色盲 5
PDE6C、MET455VAL
Thiadens 等人在 2 名临床诊断为完全色盲(ACHM5;参见 613093)的姐妹中(2009) 鉴定了 PDE6C 基因外显子 10 中 1363A-G 转变的复合杂合性,导致位于 GAF-B 结构域下游的保守残基处发生met455-val(M455V) 取代,以及 633G-外显子 2(600827.0006) 中的 C 颠换,导致功能中性错义变化。作者指出,预计该突变将完全废除剪接供体位点,导致外显子 2 丢失或内含子 2 包含在内。未受影响的亲本分别为其中 1 个突变的杂合子;未受影响的亲本分别为 1 个突变的杂合子。在 180 个种族匹配的对照中没有发现突变。姐妹俩分别在 11 岁和 12 岁时首次接受检查,她们有严重的畏光、眼球震颤,她们最好的眼睛的视力为 0.16(20/100),在接下来的 20 年里下降到 1.10(20/200)。 。 ERG 检查显示即使在儿童时期也没有视锥反应,但分别在 36 岁和 37 岁时观察到正常的视杆反应。
.0006 色盲 5
PDE6C、外显子 2、633G-C
Thiadens 等人讨论了 PDE6C 基因外显子 2 中的 633G-C 颠换,该颠换在 2 名完全色盲姐妹(ACHM5;参见 613093)中以复合杂合状态发现(2009),参见 600827.0005。
.0007 色盲 5
PDE6C、IVS1AS、T-A、-12
在 2 名患有全色盲 5 号(ACHM5;参见 613093)的姐妹中,Chang 等人(2009) 鉴定了 PDE6C 基因内含子 1 中的 481-12T-A 颠换和内含子 11(600827.0008) 中的 1483-2A-G 转换的复合杂合性。他们未受影响的母亲为 481-12T-A 突变杂合子,该突变在 100 名对照者中未发现,而他们未受影响的父亲和未受影响的兄弟为 1483-2A-G 突变杂合子。第1483章-2A-G 突变导致外显子 12 完全丢失,预测 49 个氨基酸残基的框内缺失。
.0008 色盲 5
PDE6C、IVS11AS、A-G、-2
Chang 等人讨论了 PDE6C 基因内含子 11 中的 1483-2A-G 转变,该基因在 2 名全色盲姐妹(ACHM5;参见 613093)中以复合杂合状态发现(2009),参见 600827.0007。
.0009 色盲 5
PDE6C、HIS602LEU
在 2 名患有色盲 5 号(ACHM5;参见 613093)的兄弟中,Chang 等人(2009) 鉴定了 PDE6C 基因中 1805A-T 颠换和 2368G-A 转换的复合杂合性,分别导致 his602-to-leu(H602L) 和 glu790-to-lys(E790K; 600827.0010) 取代。他们未受影响的母亲是 H602L 杂合子,而他们未受影响的父亲和未受影响的姐妹是 E790K 杂合子;在 100 个对照中没有发现这两种突变。 COS-7 细胞中的瞬时表达研究表明,2368G-A 突变诱导外显子 21 的部分跳跃,这预示着移码突变,但大约 60% 的转录本正确剪接并含有 E790K 替换。表达“人源化”Sf9昆虫细胞中cGMP水解活性的分析含有突变的 PDE5/PDE6 构建体仅显示 H602L 的基线活性,与未转染的对照没有显着差异,而 E790K 突变体具有相当大的残留活性,达到野生型的约 40%。
.0010 色盲 5
PDE6C、GLU790LYS
Chang 等人讨论了 PDE6C 基因中的 glu790-to-lys(E790K) 突变,该突变在 2 位全色盲兄弟(ACHM5;参见 613093) 中以复合杂合状态发现(2009),参见 600827.0009。
.0011 色盲 5
PDE6C、ARG276TER
在一名患有全色盲 5 号(ACHM5;参见 613093)的男性患者中,Chang 等人(2009) 鉴定了 PDE6C 基因中 826C-T 转变和 2457T-A 颠换的复合杂合性,分别导致 arg276-to-ter(R276X) 和 tyr819-to-ter(Y819X; 600827.0012) 取代。这些突变分别在未受影响的父母的杂合性中被发现。
.0012 色盲 5
PDE6C、TYR819TER
Chang 等人讨论了 PDE6C 基因中的 tyr819-to-ter(Y819X) 突变,该突变在全色盲-5(ACHM5;参见 613093) 患者的复合杂合状态下发现(2009),参见 600827.0011。
.0013 色盲 5
PDE6C、1-BP INS、1682A
在一名患有全色盲 5 号(ACHM5;参见 613093)的男性患者中,Chang 等人(2009) 鉴定出 PDE6C 基因中 1 bp 插入(1682_1683insA) 的纯合性,预计会导致移码,导致残基 561 处出现过早终止密码子。他未受影响的父母和妹妹对于该突变是杂合的。
.0014 色盲 5
PDE6C、ILE279THR
讨论 PDE6C 基因中的 c.836T-C 转变(c.836T-C,NM_006204.3),导致 ile279 至 thr(I279T) 取代,该取代在患有以下疾病的患者中以复合杂合状态发现:全色盲(ACHM5;参见 613093),作者:Weisschuh 等人(2018),参见 600827.0001。