锌指 CCCH 结构域蛋白 7B; ZC3H7B
与 NSP3 1 相关的轮状病毒 X 蛋白; ROXAN1
ROXAN
KIAA1031
HGNC 批准的基因符号:ZC3H7B
细胞遗传学位置:22q13.2 基因组坐标(GRCh38):22:41,301,525-41,360,147(来自 NCBI)
▼ 说明
ZC3H7B 是一种 RNA 结合蛋白,可能参与转录调节。 ZC3H7B 与轮状病毒非结构蛋白 NSP3 相互作用,并可能在轮状病毒复制中发挥作用(Vitour 等人,2004)。 ZC3H7B 似乎也在 microRNA(miRNA) 的生物发生中发挥作用(Treiber et al., 2017)。
▼ 克隆与表达
Vitour 等人通过对猴肾 CV-1 细胞 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选,鉴定与轮状病毒非结构蛋白 NSP3 相互作用的蛋白质,然后进行数据库分析(2004) 鉴定出人类 ZC3H7B,他们将其称为 ROXAN1。人 ROXAN1 含有 977 个氨基酸,计算分子量为 110 kD。 ROXAN1 在其 N 端半部具有四肽重复序列(TPR) 和亮氨酸-天冬氨酸(LD) 蛋白质-蛋白质相互作用基序,在其 C 端半部具有 1 个 C2H2 型和 4 个 C3H1 型锌指基序。 ROXAN1 还具有 C 端卷曲螺旋结构域。数据库分析表明 ROXAN1 mRNA 普遍表达。数据库分析确定了 ROXAN1 在哺乳动物、鱼类、两栖动物、鸟类和无脊椎动物脊索动物海鞘中的明确直系同源物。
▼ 测绘
维图尔等人(2004) 指出 ZC3H7B 基因对应到染色体 22。
Gross(2018) 根据 ZC3H7B 序列(GenBank AF188530) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ZC3H7B 基因对应到染色体 22q13.2。
▼ 基因功能
Vitour 等人通过酵母 2-杂交分析、转染 COS-7 细胞中的免疫共沉淀分析以及转染 HEK293 细胞中的突变分析(2004)表明ROXAN1的LD基序在轮状病毒感染期间与NSP3的氨基酸163至240相互作用。与 ROXAN1 相互作用所需的 NSP3 区域包括 NSP3 二聚化结构域的一部分,并且靠近 eIF4G(EIF4G1;600495)结合结构域。在转染的 COS-7 细胞中进行的酵母夹心杂交实验和免疫沉淀分析表明,NSP3 二聚体可以同时与 ROXAN1 和 eIF4G 相互作用,在轮状病毒感染的细胞中形成三元复合物。在转染的 HEK293 细胞中,ROXAN1 和 eIF4G 仅在 NSP3 存在的情况下相互作用。维图尔等人(2004) 假设 ROXAN1 可能在转录调节中发挥作用。
Harb 等人通过对 NSP3-ROXAN 复合物进行建模(2008) 鉴定了 NSP3 中的 2 个突变,即 arg187 突变为 glu(R187E) 和 lys191 突变为 glu(K191E),这些突变破坏了 NSP3 与 ROXAN 的相互作用,但不影响 eIF4G 结合。利用这些突变,作者发现 NSP3-ROXAN 相互作用的破坏显着降低了 PABPC1(604679)(一种核质穿梭蛋白)的核定位效率。转染的 HEK293 细胞中的免疫共沉淀分析表明,PABPC1 和 ROXAN 以不同的序列特异性结合 RNA,并通过 RNA 中间体相互作用。 PABPC1 使用 CRM1(XPO1; 602559) 依赖性输出途径退出细胞核,该途径依赖于 CRM1 与核输出信号的相互作用。突变分析表明,ROXAN LD 结构域可以在 PABPC1 输出中充当 NES。免疫荧光分析表明,在未感染的细胞中,ROXAN 和 PABC1 主要分别定位于细胞核和细胞质,而轮状病毒感染的细胞的细胞核中积累了 PABPC1,并且 ROXAN 被耗尽。哈布等人(2008) 得出结论,ROXAN 是参与 PABC1 核细胞质定位的 NSP3 的细胞伴侣。
Treiber 等人使用基于蛋白质组学的下拉方法(2017) 发现人类 ZC3H7B 及其旁系同源物 ZC3H7A(619819) 与 MIR7-1(615239)、MIR16-2 和 MIR29A(610782) 前体的发夹相互作用。进一步分析表明,ZC3H7 蛋白识别发夹顶端环中的 ATA(A/T) 基序。 HEK293 细胞中 ZC3H7B 的敲除降低了成熟 MIR7 的水平。 HEK293 细胞中 ZC3H7A 和 ZC3H7B 的敲除证实了这些蛋白质在调节 MIR7-1 生物发生方面发挥着冗余作用。