EMI 结构域蛋白 2; EMID2
EMU2
胶原蛋白,XXVI 型,α-1; COL26A1
HGNC 批准的基因符号:COL26A1
细胞遗传学位置:7q22.1 基因组坐标(GRCh38):7:101,362,388-101,559,024(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
佐藤等人(2002) 使用 Hsp47(600943) 作为诱饵,通过酵母 2 杂交分析克隆了 小鼠 Emid2,他们将其称为 Col26a1。推导的 438 个氨基酸蛋白质包含一个 N 端信号序列,后面是 3 个非胶原结构域,其中 3 个非胶原结构域被 2 个胶原结构域隔开。 Emid2 在第一个非胶原区域的 N 末端部分具有 13 个半胱氨酸残基和 2 簇 gly-X-Y 胶原样重复序列。 Northern印迹分析检测到新生儿睾丸和卵巢中表达最高,成人睾丸和卵巢中表达较低。免疫组织化学分析在睾丸和卵巢的细胞外基质中检测到Emid2。
通过在数据库中搜索与 EMID1(608926) 相似的序列,Leimeister 等人(2002) 鉴定了 2 个编码 EMID2 的剪接变体,他们将其命名为 EMU2。推导的蛋白质含有441和439个氨基酸。 EMID2 包含一个 N 端信号肽,随后是一个 emilin(EMI) 结构域、2 个胶原蛋白片段和一个新的 C 端结构域。 EMI 结构域包含 7 个可能介导二聚化的保守半胱氨酸。小鼠胚胎的原位杂交检测到胚胎第9.5天的体节以及头部和鳃弓的间充质细胞中Emid2的表达。在发育后期,Emid2 在唾液腺、内耳和与 Emid1 阳性上皮相邻的发育中肾单位的间充质中表达。 Emid2 还在脊神经和神经节、头部间充质和骨骼肌中表达。
▼ 基因功能
佐藤等人(2002) 确定小鼠 Emid2 显示出胶原蛋白样特征,包括羟基化和 N-糖基化。发现 N-聚糖在分泌前在高尔基体中被修饰成更复杂的形式。此外,Emid2形成三聚体,并分泌到转染的人胚胎肾细胞的培养基中。脉冲追踪实验表明分泌需要后修饰。
雷迈斯特等人(2002) 确定 Emid2 和 Emid1 是 N-糖基化蛋白,以单体形式存在,但它们可以形成同二聚体、同三聚体或更大的复合物。 Emid2 和 Emid1 还可以通过其 EMI 结构域形成异聚复合物。这两种蛋白质均由转染的人胚胎肾细胞分泌并沉积在细胞外基质中。
▼ 基因结构
雷迈斯特等人(2002) 确定 EMID2 基因包含 13 个外显子,跨度 196 kb。
莱蒂斯等人(2011) 在 EMID2 的内含子内鉴定出一个高度保守的非编码元件,他们将其称为 HCNE2。他们发现 HCNE2 在小鼠胚胎中起到肢芽增强子的作用。在一名患有从头 7q 倒转、前脑无裂畸形以及严重上肢并指和下肢并指多指特征的儿童中,Lettice 等人(2011) 发现该儿童的肢体表型是由于 Sonic Hedgehog(SHH; 600725) 与 HCNE2 的接近度增加以及由此产生的 SHH 异位表达所致。莱蒂斯等人(2011) 将这种疾病机制称为“增强子采用”。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Leimeister 等人(2002) 将 EMID2 基因定位到染色体 7q22.1。