DEAH 框解旋酶 36; DHX36
DEAH框多肽36
G4 解析酶 1; G4R1
与富含 AU 元素相关的 RNA 解旋酶; RHAU
KIAA1488
HGNC 批准的基因符号:DHX36
细胞遗传学位置:3q25.2 基因组坐标(GRCh38):3:154,272,546-154,324,487(来自 NCBI)
▼ 说明
稳定的环状鸟嘌呤四联体由 4 个鸟嘌呤分子自组装形成,这些四联体可以自缔合成垂直堆叠,称为 G 四联体。具有 3 个或更多鸟嘌呤的 DNA 或 RNA 分子可以形成复杂的 G 四链体结构,称为 G4-DNA 或 G4-RNA。这些 G-四链体结构具有热力学稳定性,并且发现于遗传控制区域附近,包括 mRNA 剪接和聚腺苷酸化位点、启动子区域和端粒。 DHX36 是一种酶,可将 G4 结构分解成单独的核苷酸链,用于富含 G 序列的代谢处理(Creacy 等,2008)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2000) 克隆了 DHX36,他们将其命名为 KIAA1488。推导的 852 个氨基酸的蛋白质与酵母和植物 RNA 解旋酶具有相似性。 RT-PCR ELISA 检测到胎儿肝脏和成人肝脏、肾脏、脊髓、全脑和所有检查的特定脑区域中表达相对较低。在检查的所有其他组织中,包括胎儿大脑,表达均较弱。
Vaughn 等人使用 G4-DNA 亲和柱纯化 HeLa 细胞中的 G4-DNA 解析酶,然后进行质谱分析(2005) 鉴定出 DHX36。推导的蛋白质的计算分子量为 115 kD。通过 SDS-PAGE 检测其表观分子质量为 120 kD。
▼ 基因功能
沃恩等人(2005) 发现重组人 DHX36 显示出强大的 G4-DNA 解析活性。 DHX36 形成 DNA 单体需要 ATP 和 Mg(2+)。 DHX36 不能解析 Y 型双链体 DNA 或具有 5 引物或 3 引物突出端的双链体 DNA。 DHX36 很容易解析核糖体 G4-DNA。相反,DHX36 与免疫球蛋白重链开关区产生的 TP G4-DNA 结合良好,但溶解速度缓慢。
克里西等人(2008) 发现重组人 DHX36 以高亲和力结合 G4-RNA 和 G4-DNA,并对两种底物表现出强大的解析活性。 DHX36 以比 G4-DNA 稍高的亲和力结合 G4-RNA,并且似乎以单体和多聚体形式结合 G4-RNA。竞争研究表明,与相同序列的 G4-DNA 相比,DHX36 更喜欢 G4-RNA,但两者都很容易分解为单体。克里西等人(2008) 得出结论,DHX36 是一种四链体核酸监视蛋白,能够去除四链体“结”,允许富含 G 的 RNA 和 DNA 顺利代谢加工。
通过使用生物素化聚 I:C 进行免疫沉淀和蛋白质下拉分析,Zhang 等人(2011) 在小鼠骨髓树突状细胞(mDC) 中鉴定出一种胞质、不依赖于内体的病毒核苷酸传感器,该传感器由 RNA 解旋酶 Ddx1(601257)、Ddx21(606357) 和 Dhx36 以及转换因子分子 Trif(TICAM1; 607601) 组成)。双链 RNA(dsRNA) 传感器 Pkr(EIF2AK2; 176871) 和 Lgp2(DHX58; 608588) 也被沉淀。通过短发夹 RNA 敲低每个解旋酶可阻断 mDC 装载 I 型干扰素(参见 147660)的能力以及对 Poly I:C、甲型流感和呼肠孤病毒的细胞因子反应。 Ddx1 通过其解旋酶 A 结构域结合聚 I:C,而 Dhx36 和 Ddx21 分别通过其 HA2-DUF 和 PRK 结构域结合 Trif 的 TIR 结构域。张等人(2011) 得出结论,DDX1-DDX21-DHX36 复合物是一种 dsRNA 传感器,它使用 TRIF 途径激活 mDC 胞质中的 I 型干扰素反应。
▼ 生化特征
晶体结构
陈等人(2018) 报道了牛 DHX36 与具有 G-四链体和 3-prime 单链 DNA 片段的 DNA 结合的共晶结构,并表明 N 端 DHX36 特异性基序折叠成 DNA 结合诱导的 α-螺旋与 OB 折叠状子结构域一起选择性地结合平行的 G-四链体。与未配体和 ATP 类似物结合的 DHX36 结构的比较以及单分子荧光共振能量转移分析表明,G-四链体结合单独诱导解旋酶核心的重排;通过拉动单链 DNA 尾部,这些重排驱动 G-四链体一次展开 1 个残基。
▼ 测绘
Hartz(2009) 根据 DHX36 序列(GenBank AB040921) 与基因组序列(build 36.1) 的比对,将 DHX36 基因对应到染色体 3q25.2。