ELMO/CED12 域包含蛋白 2； ELMOD2

HGNC 批准的基因符号：ELMOD2

细胞遗传学位置：4q31.1 基因组坐标（GRCh38）：4:140,524,168-140,553,770（来自 NCBI）

▼ 说明

ELMOD2 作为小 GTPases 的 ARL（参见 ARL2，601175）和 ​​ARF（参见 ARF1，103180）家族成员的 GTP 酶激活蛋白（GAP）发挥作用（Bowzard 等，2007）。

▼ 克隆与表达

施特劳斯伯格等人（2002） 鉴定了 ELMOD2 基因，该基因编码 293 个氨基酸的蛋白质。

使用 RT-PCR Hodgson 等人（2006） 发现 ELMOD2 mRNA 在所研究的所有人体组织和细胞类型中表达，骨骼肌除外。利用原位杂交，作者识别了健康肺中肺泡巨噬细胞和肺泡壁的表达。

Bowzard 等人通过数据库分析来鉴定与牛睾丸 Elmod2 相似的蛋白质，然后对胎儿大脑 cDNA 文库进行 RT-PCR（2007） 克隆人类 ELMOD2。推导的 293 个氨基酸蛋白与牛 Elmod2 具有 94% 的同一性。 ELMOD2 包含一个 C 端 ELMO 结构域，但缺少在较大的含有 ELMO 结构域的蛋白质（如 ELMO1（606420））中发现的 C 端连续-白细胞 C 分裂底物（PLEK; 173570） 同源结构域。 Northern 印迹分析检测到 1.3 kb 转录物在胃和睾丸中微弱表达，但在其他人体组织中没有表达。数据库分析揭示了 ELMOD2 在脊椎动物中的直系同源物，但在早期真核生物中却没有。

▼ 基因结构

ELMOD2 基因由 9 个外显子组成（Strausberg 等，2002）。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Hodgson 等人（2006） 将 ELMOD2 基因对应到染色体 4q31。

▼ 基因功能

鲍扎德等人（2007） 发现转染 ELMOD2 的 HeLa 细胞对 ARL2、ARL3（604695）、ARF1 和 ARF6（600464） 显示出升高的 GAP 活性，但对 RHOA（165390）、RAC1、（602048） 和 RAN（601179） 则没有。重组人ELMOD2或纯化的牛Elmod2的GAP活性比归因于Elmod2的未纯化的牛睾丸GAP的稳定性差得多。在未纯化的形式中，GAP 活性与表观分子质量超过 130 万道尔顿的蛋白质复合物相关。

▼ 分子遗传学

霍奇森等人（2006） 在芬兰东南部萨沃省的一组病例中，将 ELMOD2 基因确定为导致家族性特发性肺纤维化（IPF; 178500） 的突变位点的候选基因。最初的全基因组扫描确定了 5 个感兴趣的位点。对来自同一地理区域的 24 个家族进行的扩展数据集中的分层精细作图显示，染色体 4q31 上有一个共享的 110 kb 至 13 Mb 单倍型，该单倍型在患者中比基于人群的对照中出现的频率显着更高（比值比 6.3；95%） CI 2.5-15.9；P = 0.0001）。共享的单倍型包含 ELMOD2 和 LOC152586（610310） 基因。虽然在健康人肺中检测到 ELMOD2 表达，但在几种杂交条件下，在 IPF 肺样本中未发现 ELMOD2 的特异性信号。发现 ELMOD2 的外显子 1 至 3 位于易感性单倍型内。在进行基因组扫描的每个 IPF 家族的 1 名受影响患者中，对 ELMOD2 的所有 9 个外显子和外显子-内含子边界进行了测序。在编码区或外显子-内含子边界没有发现突变。