SEC16 同源物 B,内质网输出因子; SEC16B
SEC16,酿酒酵母,同源物,B
亮氨酸拉链转录调节子2; LZTR2
REGUCALCIN 基因启动子区域相关蛋白; RGPR
SEC16S
HGNC 批准的基因符号:SEC16B
细胞遗传学位置:1q25.2 基因组坐标(GRCh38):1:177,928,788-177,984,284(来自 NCBI)
▼ 说明
SEC16B 是酿酒酵母 Sec16 的哺乳动物同源物,是组织过渡内质网(ER) 位点和蛋白质输出所必需的(Bhattacharyya 和 Glick, 2007)。
▼ 克隆与表达
通过酵母 1-杂交筛选大鼠肝脏 cDNA 文库与大鼠 regucalcin(RGN; 300212) 启动子序列的相互作用,然后通过 RACE-PCR,Misawa 和 Yamaguchi(2001) 克隆了大鼠 Sec16b,他们将其称为 Rgpr。随后,他们通过 RACE-PCR 克隆了人类和小鼠序列。推导的 1,060 个氨基酸的人 SEC16B 蛋白的计算分子量为 117 kD。对大鼠组织进行 Northern 印迹分析,在肝脏、肾脏、心脏、脾脏和大脑中检测到 4.5 kb 的转录物。 SEC16B 包含预测的磷酸化、N-肉豆蔻酰化、N-糖基化和酰胺化位点,以及亮氨酸拉链基序和疏水性 N 末端区域。
Bhattacharyya 和 Glick(2007) 澄清,有 2 个 SEC16 哺乳动物同源物,一个较长的 SEC16A(612854) 和一个较短的 SEC16B,他们将其称为 SEC16S。两种蛋白质都定位于过渡内质网位点。通过数据库分析,然后对人肝脏 cDNA 文库进行 PCR,他们孤立克隆了 SEC16B。
▼ 基因功能
Bhattacharyya 和 Glick(2007) 表明 SEC16B 的 siRNA 减少导致特异性 ER-高尔基体定位的丧失以及剩余 SEC16B 蛋白的更分散的定位。他们得出的结论是,在 HeLa 细胞中,SEC16B 是组织过渡 ER 位点和 ER 输出所必需的,并且 SEC16B N 端区域是过渡 ER 位点定位所必需的。免疫共沉淀研究表明 SEC16B 和 SEC16A 形成异聚复合物。
▼ 基因结构
Misawa 和 Yamaguchi(2001) 确定 SEC16B 基因至少包含 26 个外显子,跨度为 4.1 kb。
▼ 测绘
通过数据库分析,Misawa 和 Yamaguchi(2001) 将 SEC16B 基因对应到染色体 1q25.2。