ATP 结合框,亚科 A,成员 10; ABCA10
HGNC 批准的基因符号:ABCA10
细胞遗传学位置:17q24.3 基因组坐标(GRCh38):17:69,148,007-69,244,848(来自 NCBI)
▼ 说明
ABC 转运蛋白,例如 ABCA10,构成一组复杂的结构相关的多跨跨膜蛋白,可跨细胞膜转运多种底物(Wenzel 等,2003)。
▼ 克隆与表达
通过使用与人 ABCA6(612504)、ABCA8(612505) 和 ABCA9(612507) 同源的简并引物对人巨噬细胞 cDNA 进行 PCR,Wenzel 等人(2003)克隆了ABCA10。推导的 1,543 个氨基酸的蛋白质的计算分子量约为 176 kD。它包含 2 个核苷酸结合折叠,每个折叠都具有特征性的 Walker A 和 B 基序,以及 2 个跨膜结构域,每个跨膜结构域由 6 个跨膜片段组成。 ABCA10 在其胞外环中有 3 个潜在的 N-糖基化位点。 ABCA10 与 ABCA6、ABCA8 和 ABCA9 具有 62% 至 63% 的氨基酸同一性,并且与这些蛋白质一样,它仅在其 N 端核苷酸结合折叠中具有 ABC 转运蛋白特征序列。然而,与 ABCA6、ABCA8 和 ABCA9 不同,ABCA10 在其 N 端跨膜结构域和核苷酸结合折叠之间具有 PEST 序列。温泽尔等人(2003) 还鉴定了 4 个 ABCA10 剪接变体,其中 3 个改变了阅读框。 RNA点印迹分析检测到ABCA10在所有检查组织中表达,其中心脏、大脑和胃肠道中的表达水平最高。
▼ 基因功能
温泽尔等人(2003)表明ABCA10 mRNA的表达在人单核细胞分化为巨噬细胞的过程中没有变化。巨噬细胞负载低密度脂蛋白抑制了 ABCA10 表达,而高密度脂蛋白介导的胆固醇输出则诱导 ABCA10 mRNA 上调。
▼ 基因结构
温泽尔等人(2003) 确定 ABCA10 基因跨度为 97 kb,包含 41 个外显子,包括用于截短的 ABCA10 剪接变体的替代外显子 4。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Wenzel 等人(2003) 将 ABCA10 基因对应到染色体 17q24.3。它与 ABCA5(612503)、ABCA6、ABCA8 和 ABCA9 聚类。