细胞周期L1; CCNL1

活动和神经递质诱导的基因 6A; ANIA6A

HGNC 批准的基因符号:CCNL1

细胞遗传学位置:3q25.31 基因组坐标(GRCh38):3:157,143,121-157,160,147(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

伯克等人(2001)克隆了大鼠 Ccnl1 的 2 个剪接变体,他们将其称为 Ania6a。较短的变体编码全长异构体,Berke 等人(2001) 根据其计算的分子量将其指定为 Ania6a60。 Ania6a60 包含一个 N 端细胞周期蛋白框和一个带有多个精氨酸/丝氨酸(RS) 二肽和 4 个潜在核定位信号的 C 端区域。较长的变体编码 Ania6a25,它也以其计算的分子质量命名。 Ania6a25 在细胞周期蛋白框末端附近被截断。伯克等人(2001) 在 EST 数据库中鉴定了两种 Anai6a 剪接变体的人类直向同源物。两种剪接变体共有的 3-prime UTR 在人类和大鼠之间具有 98% 的同一性,而编码区则具有 93% 的同一性。 Northern 印迹分析在所有检查的大鼠组织中均检测到了 Ania6a 转录本,并且在人体组织中也获得了类似的结果。 COS-7 细胞在核斑点中表达大鼠 Ania6a60,但排除核仁。 Ania6a25 在细胞核和细胞质中均表达。

Dickinson 等人通过在 EST 数据库中搜索编码新型细胞周期蛋白的序列,然后对人肺和淋巴细胞 cDNA 文库进行 PCR(2002) 克隆了 3 个细胞周期蛋白 L 剪接变体。他们将这种全长蛋白质称为细胞周期蛋白 L-α,包含 526 个氨基酸,计算出的分子量为 59.6 kD。它具有 N 端细胞周期蛋白框和 C 端 SR 富含区域。其他 2 个亚型,细胞周期蛋白 L-β 和 -γ,C 端被截短,分别包含 232 个和 172 个氨基酸。 Northern 印迹分析检测到所有检查组织中 4.5-和 2.3-kb 转录物的可变表达。 2.3-kb 条带可能代表 α 和 β 转录本,4.5-kb 条带可能代表 γ 转录本,它保留了从内含子 5 开始的所有内含子。Western blot 分析在 HeLa 细胞中以表观分子水平检测到了主要的细胞周期蛋白 L 蛋白。质量在 55 至 60 kD 之间。

Loyer 等人使用 Northern blot 和 RT-PCR 分析(2008) 鉴定了 9 种不同的细胞周期蛋白 L1 剪接变体,它们在人脑、肝脏、睾丸、脾脏和胸腺中以组织依赖性方式不同地表达。其中 7 个变体编码 L1-γ 同工型,彼此之间的差异仅在于 3-prime UTR。另外两个变体分别编码 L1-α 和 L1-β 同工型。对几种人类细胞系的免疫荧光分析检测到核质和大核斑点中的所有细胞周期蛋白 L1 和 L2(CCNL2; 613482) 同种型,并显示与 CDK11 的 p110 同种型共定位(参见 CDK11A; 116951)。

▼ 基因功能

Dickinson 等人使用抗细胞周期蛋白 L 抗体(2002) 发现一种对 RNA pol II 有活性的激酶(参见 POLR2A;180660)C 末端结构域(CTD) 与 HeLa 细胞核提取物中的细胞周期蛋白 L 共免疫沉淀。该激酶还磷酸化组蛋白 H1(参见 142709)和 SC35(SFRS2 600813),但不磷酸化其他含 SR 的蛋白质底物。该激酶对 p21 浓度的增加敏感(CDKN1A;116899)。免疫共沉淀和蛋白质印迹分析显示,细胞周期蛋白 L 与激酶 PITSLRE 的 p110 同工型相互作用(参见 CDK11A;116951),并且在体外激酶测定中 PITSLRE 对 p21 敏感。抗细胞周期蛋白 L 抗体还抑制 HeLa 细胞核提取物对前体 RNA 的体外剪接,并且 RNA 剪接中间体随时间累积的模式表明该抗体抑制剪接的第二步。此外,cyclin L 刺激 RNA 剪接,而 p21 抑制剪接。狄金森等人(2002) 得出结论,细胞周期蛋白 L 和细胞周期蛋白 L 相关激酶 PITSLRE 在 RNA 剪接中发挥重要作用。

伯克等人(2001) 表明,Ania6a 的表达是由体内表达多巴胺 D1 受体(DRD1;126449)的成年大鼠纹状体神经元中的可卡因以及大鼠 PC12 嗜铬细胞瘤细胞中的生长因子诱导的。各种刺激对Ania6a转录本的诱导具有特定的影响:多巴胺诱导Ania60和Ania6a25,谷氨酸选择性诱导Ania6a60,去极化浓度的KCl优先诱导Ania6a25。瞬时表达的 Ania6a60 与 pol II 的过度磷酸化形式共定位。酵母 2-杂交分析表明 Ania6a60 直接与 Sc35 相互作用,免疫共沉淀分析表明 Ania6a60 与 Pitslre 的 p110 同工型相互作用,但不与任何其他测试的细胞周期蛋白相互作用。伯克等人(2001) 得出结论,ANIA6A 是与过度磷酸化 pol II 相关的整合核 RNA 加工复合物的一个组成部分。

斯甘巴托等人(2003) 发现培养的大鼠纹状体神经元中 Anai6a 表达和剪接的调节是通过主要集中在 CREB ​​上的信号通路控制的(123810)。谷氨酸诱导长 Ania6 mRNA,并依赖于 NMDA 受体的激活(参见 138251)。 Forskolin 或脑源性神经营养因子(BDNF; 113505) 依赖于 ERK(参见 601795)来诱导短 Ania6a mRNA,该 mRNA 编码全长蛋白质。最后,KCl 介导的短转录物诱导需要激活 L 型钙通道(参见 114205)。

Loyer 等人通过对人类细胞系进行免疫沉淀分析和蛋白质下拉测定(2008) 发现细胞周期蛋白 L1 和 L2 的 α 和 β 同工型(但不是细胞周期蛋白 L1 的 γ 同工型)与 CDK11 的 p110 同工型在高分子复合物中相互作用,该复合物在体外表现出剪接活性。细胞周期蛋白 L1 和 L2 的 α 同工型也与 CDK11 的 p58 和 p46 同工型相互作用。体内剪接测定表明,细胞周期蛋白 L1-α、L1-β、L2-α 或 L2-β 和/或 p110 CDK11 的表达增加了内含子剪接活性,并改变了细胞周期蛋白 L1 和 L2 亚型中的选择性剪接位点选择。和细胞类型特异性的方式。

▼ 基因结构

狄金森等人(2002) 确定 CCNL1 基因包含 14 个外显子,跨度为 12.4 kb。终止密码子存在于外显子 4、7 和 14 中,并且外显子 4 和 7 在全长 CCNL1 转录本中被跳过。外显子 1 和大部分外显子 2 包含在 CpG 岛内,启动子区域缺少 TATA 框。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Dickinson 等人(2002) 将 CCNL1 基因对应到染色体 3q23。 Gross(2010) 根据 CCNL1 序列(GenBank AF180920) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 CCNL1 基因对应到染色体 3q25.31。

Tags: none