分泌球蛋白,家族 1D,成员 4; SCGB1D4

干扰素-γ诱导的分泌球蛋白;IIS

HGNC 批准的基因符号:SCGB1D4

细胞遗传学位置:11q12.3 基因组坐标(GRCh38):11:62,296,281-62,299,075(来自 NCBI)

▼ 说明

分泌球蛋白家族的成员,例如 SCGB1D4,是约 10 kD 的分泌蛋白,在肺、泪腺、唾液腺、前列腺、子宫和其他组织的液体中高浓度存在。分泌球蛋白在分泌前形成稳定的二聚体(Jackson 等人的总结,2011)。

▼ 克隆与表达

Choi 等人使用简并引物从永生化正常人淋巴母细胞系总 RNA 中扩增分泌球蛋白 cDNA(2004) 克隆了 SCGB1D4,他们将其称为 IIS。他们还从人结肠癌细胞总 RNA 中扩增出全长 IIS。推导的 83 个氨基酸肽的计算分子量为 9.2 kD。去除 N 端信号肽产生 62 个氨基酸的成熟蛋白。 Northern 印迹分析未检测到 SCGB1D4 转录物,但半定量 RT-PCR 扩增显示所有检查的组织中都有可变的 IIS 表达。 IIS 表达最高的是卵巢、淋巴结、扁桃体以及淋巴母细胞系。

▼ 基因功能

Choi 等人使用实时 PCR(2004) 发现干扰素-γ(IFNG; 147570) 增加了培养的人淋巴母细胞中 IIS mRNA 的表达。此外,与静息细胞相比,IIS mRNA 在活化的 CD8(参见 186910)阳性 T 细胞和 CD19(107265)阳性 B 细胞中上调,但在活化的 CD4(186940)阳性 T 细胞中没有上调。通过用 IIS 反义寡核苷酸转染来敲低 IIS,可显着抑制人淋巴母细胞的趋化迁移和侵袭。

▼ 基因结构

崔等人(2004) 确定 SCGB1D4 基因包含 3 个外显子,跨度约为 3 kb。只有最后一个外显子编码蛋白质。崔等人(2004) 还在 SCGB1D4 基因的近端启动子区域鉴定了几个转录因子结合位点。

▼ 测绘

Hartz(2013) 根据 SCGB1D4 序列(GenBank AY236538) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 SCGB1D4 基因对应到染色体 11q12.3。

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