RCAN 家庭成员 3; RCAN3
唐氏综合症关键区域基因 1-样 2; DSCR1L2
富含心肌细胞的钙调磷酸酶相互作用蛋白 3; MCIP3
HGNC 批准的基因符号:RCAN3
细胞遗传学位置:1p36.11 基因组坐标(GRCh38):1:24,502,344-24,541,040(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Strippoli等人通过EST数据库检索和全外周血和胎盘总RNA的RT-PCR(2000) 克隆了 RCAN3,他们将其称为 DSCR1L2。 DSCR1(RCAN1; 602917) 基因家族的成员具有假定的单链核酸结合结构域(类似于 RNA 识别基序)和高度保守的丝氨酸-脯氨酸基序。推导的全长 241 个氨基酸的 DSCR1L2 蛋白与 DSCR1 有 61% 相同,与 ZAKI4(DCSR1L1 或 RCAN2;604876)有 68% 相同。斯特里波利等人(2000) 还从血液 RNA 中克隆了 DSCR1L2 剪接变体,该变体编码缺乏 10 个中心氨基酸的推导蛋白质。 Northern 印迹分析显示 3.2、5.2 和 7.5 kb DSCR1L2 转录物普遍表达,在心脏、骨骼肌、肾脏、肝脏和外周血白细胞中表达最高,在脑、胸腺、脾脏、小肠中表达较低、胎盘和肺。
Canaider 等人使用心肌肌钙蛋白 I(TNNI3;191044)作为酵母 2 杂交筛选心脏 cDNA 文库的诱饵,然后对心脏 RNA 进行 RT-PCR(2006)克隆了DSCR1L2。他们还克隆了一个 DSCR1L2 剪接变体,将其称为 DSCR1L2-E2E5,其外显子 2 直接剪接到外显子 5。推导出的 115 个氨基酸 DSCR1L2-E2E5 蛋白与 DSCR1L2 的前 66 个氨基酸相同,但超出了- 框架拼接创建了独特的 C 端一半。 RT-PCR 检测心脏、骨骼肌和大脑中 DSCR1L2-E2E5 的表达。在心脏中,DSCR1L2 与 DSCR1L2-E2E5 的比率为 3.5 比 1。
▼ 基因功能
Canaider 等人使用酵母 2-杂交分析和蛋白质下拉分析(2006)表明DSCR1L2和DSCR1L2-E2E5均结合TNNI3。结构域分析表明,DSCR1L2 外显子 2 编码的区域介导了相互作用。
▼ 基因结构
斯特里波利等人(2000) 确定 DCR1L2 基因包含 4 个外显子,并且启动子区域包含 TATAAA 框。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Strippoli 等人(2000) 将 DCR1L2 基因对应到 1p35.3-p33。斯特里波利等人(2000) 将小鼠 Dcr1l2 基因对应到染色体 4。