NFKB-抑制因子; NKRF
NRF
核因子 KAPPA-B 抑制因子
ITBA4
HGNC 批准的基因符号:NKRF
细胞遗传学位置:Xq24 基因组坐标(GRCh38):X:119,588,337-119,606,424(来自 NCBI)
▼ 说明
NRF 与特定负调控元件(NRE) 相互作用,介导某些核因子 kappa-B(NFKB;参见 164011) 反应基因的转录抑制。
▼ 克隆与表达
弗拉蒂尼等人(1997)获得了编码NKRF的部分序列,他们将其称为ITBA4。 Northern 印迹分析在所有检查的人体组织中检测到 4.2 kb 的转录物,其中在骨骼肌中表达最高。在心脏、脑、胎盘、肝脏和胰腺中表达中等,在肾脏和肺中表达较低。在大脑中检测到了一条额外的低分子量强带。动物园印迹分析揭示了所有检查的哺乳动物物种中可能的直向同源物。
通过筛选 HeLa 细胞 cDNA 表达文库中的 NRE 结合蛋白,然后进行滤光杂交,Nourbakhsh 和 Hauser(1999) 克隆了 NKRF,他们将其称为 NRF。推导的 388 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 43.8 kD,并包含 N 端核定位信号。 NRF C 端 92 个氨基酸构成 DNA 结合结构域,具有 4 个转角和 4 个 α 螺旋,类似于翼状螺旋-转角-螺旋 DNA 结合基序。 Northern 印迹分析检测到 3.7-和 4.0-kb 转录物的普遍表达,其 3-prime 非翻译区域有所不同。较长的转录本在大多数组织中占主导地位,但 3.7 kb 的转录本在大脑中占主导地位。荧光标记的 NRF 显示核定位,核定位信号的删除导致细胞质染色。 HeLa 细胞表达的内源性 NRF 显示出约 50 kD 的表观分子质量。
▼ 基因功能
Nourbakhsh 和 Hauser(1999) 表明,NRF 通过距离无关的机制消除了 β-干扰素(147640) 启动子中 NFKB 结合位点的转录活性。
冯等人(2002) 确定 NRF 通过与 NOS2A 启动子上游的顺式作用 NRE 结合,持续沉默诱导型一氧化氮合酶基因(NOS2A;163730)。 NRE 突变导致 NRF 结合丧失并增加基础而非细胞因子刺激的 NOS2A 转录。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Frattini 等人(1997) 将 NKRF 基因对应到染色体 Xq24-q25。
Gross(2015) 根据 NKRF 序列(GenBank BC047878) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 NKRF 基因对应到染色体 Xq24。