伤口和角质细胞迁移相关的长非编码 RNA 1; WAKMAR1
长链非编码RNAWAKMAR1
HGNC 批准的基因符号:WAKMAR1
细胞遗传学位置:20p11.21 基因组坐标(GRCh38):20:24,091,535-24,111,958(来自 NCBI)
▼ 说明
长非编码 RNA(lncRNA) 是超过 200 个核苷酸的 RNA 分子,不具有蛋白质编码潜力。 WAKMAR1 是一种 lncRNA,通过促进角质形成细胞迁移来调节伤口愈合(Li et al., 2019)。
▼ 克隆与表达
通过 RNA 测序和定量 PCR 分析,Li 等人(2019) 鉴定出人 WAKMAR1 是在人角质形成细胞中表达的核定位、RNA 聚合酶 II 转录的多聚腺苷酸化非编码转录物。 WAKMAR1 在非灵长类动物(包括小鼠)中没有同源物。
▼ 基因功能
李等人(2019) 发现人类角质形成细胞中的 WAKMAR1 表达在伤口愈合过程中显着增加,而在不愈合伤口中表达较低。在人类未愈合伤口的伤口边缘角质形成细胞中,WAKMAR1 表达下调。角质形成细胞中 WAKMAR1 的表达可由 TGF-β(TGFB1;190180)信号传导诱导。人原代角质形成细胞中 WAKMAR1 的敲除增加了角质形成细胞的运动性和人离体皮肤伤口的上皮再生。作者发现 WAKMAR1 调节对细胞迁移很重要的蛋白质编码基因网络,其中大部分受转录因子 E2F1 的控制(189971)。 WAKMAR1 通过隔离 DNA 甲基转移酶来干扰 E2F1 启动子甲基化,从而增强 E2F1 表达。
▼ 测绘
李等人(2019) 报道 WAKMAR1 基因对应到染色体 20p11.21。