染色体 16 反转, 0.45-MB

细胞遗传学定位：16p11 基因组坐标（GRCh38）：16:28,500,001-36,800,000

▼ 正文

染色体 16p11 倒位（chr16：28.25-28.7 Mb，NCBI36）影响多个基因，并可能影响对哮喘和肥胖的共同易感性（参见分子遗传学）。

▼ 细胞遗传学

马丁等人（2004） 在染色体 16 组装过程中检测到倒置变异（最大大小估计约为 0.45 Mb；28.25-28.7 Mb，NCBI36），其中 EIFVar1/NI 和 EIFVar2/I 分别是参考非倒置和倒置等位基因。冈萨雷斯等人（2014） 使用 SNP 微阵列数据，使用 2 种算法（Caceres 等人，2012） 来检测 16p11.2 处的 0.45-Mb 多态性倒位并进行基因分型，并通过等位基因特异性分子测定验证基因型预测。反转包含一个单拷贝反转间隔（119 kb），两侧是 2 个高度相似的片段重复的大块。对包含倒位的人类参考序列区域与其他哺乳动物的直系同源区域进行比较作图，揭示了人类基因组的重新分布，在人类片段重复发生的位置处存在同线性断裂。

▼ 进化

人类参考序列的倒转区域与其他哺乳动物的直向同源区域的比较作图结果向 Gonzalez 等人提出了建议（2014） 相对于祖先等位基因，人类参考染色体中必须至少发生 2 个进化染色体倒位事件。尽管非倒转等位基因在研究的人群中更为常见，但绘图数据表明倒转等位基因更为古老。假设突变率为 2.5 x 10（-8），Gonzalez 等人（2014） 估计大约 135 万年前的古代合并。

▼ 群体遗传学

冈萨雷斯等人（2014） 发现祖先 I 等位基因频率范围从东非人的 0.10 到北欧人的 0.49，分析人群之间存在显着分层。冈萨雷斯等人（2014） 假设倒转间隔两侧的 2 大块高度相似的片段重复很可能通过非同源不等重组介导进化倒转。

▼ 分子遗传学

Gonzalez 等人基于候选基因和全基因组关联研究发现 16p11.2 染色体区域与肥胖、体重指数和哮喘表型之间存在关联（2014） 研究了该区域可检测到的 0.45 Mb 多态性倒位与哮喘和肥胖共存的关系。冈萨雷斯等人（2014） 在 5 项大型孤立研究中发现反转等位基因（EIFVar2/I） 可以预防哮喘和肥胖的联合发生（从总共 5,809 个样本中抽取的 317 例病例和 543 名对照的合并样本量；合并比值比 = 0.48 ，p = 5.5 x 10（-6））。反转等位基因与邻近基因的表达水平密切相关，特别是 TUFM（602389）（p = 3.0 x 10（-40）），它编码能量平衡的线粒体蛋白调节剂和 1 型干扰素抑制剂，以及其他候选基因哮喘（IL27；608273）和肥胖（APOB48R，605220 和 SH2B1，608937）。SPNS1（612583） 和 SULT1A1（171150） 表达的增加也与相对于非倒转（NI） 染色体的倒转相关。非倒转等位基因的 SULT1A4（615819） 和 CCDC101（613374） 表达较高。等位基因频率显示出显着的全球人口分层，从东非的 10% 到北欧的 49%，这与人类迁出非洲后不一致和极端的遗传漂变或适应性选择一致。冈萨雷斯等人（2014） 得出的结论是，通过影响基因表达，16p11.2 倒位为哮喘和肥胖的联合易感性提供了遗传基础，人群归因风险为 39.7%。作者认为，反转等位基因的线粒体功能差异和基础能量平衡也可能是导致其在世界人口中分布不均的潜在选择特征的基础。