原钙粘蛋白-γ,亚家族 A,成员 3; PCDHGA3
PCDH-γ-A3
HGNC 批准的基因符号:PCDHGA3
细胞遗传学位置:5q31.3 基因组坐标(GRCh38):5:141,343,829-141,512,975(来自 NCBI)
▼ 说明
钙粘蛋白是钙依赖性细胞间粘附分子,原钙粘蛋白构成非经典钙粘蛋白的一个亚家族。PCDHGA3 是染色体 5q31 上 PCDHG 基因簇(604968) 内 22 个串联排列的基因之一。22 个 PCDHG 基因作为“可变”外显子发挥作用,分别剪接到下游恒定区以形成不同的 PCDHG 转录本。可变的 PCDHG 外显子编码原钙粘蛋白的胞外和跨膜结构域,共同区域编码胞内结构域(Wu et al., 2001)。有关 PCDHG 基因的更多信息,请参阅 604968。
▼ 克隆与表达
Wu 和 Maniatis(1999) 通过对脑 cDNA 文库进行 PCR 获得了编码 2 种 PCDHGA3 亚型的 cDNA。序列分析预测 PCDHGA3 的长亚型包含 932 个氨基酸(GenBank AAD43717),与 PCDHGC4(606305) 具有 48% 的同一性。PCDHGA3 和 PCDHGC4 的 C 端 134 个氨基酸是相同的,并且具有富含赖氨酸的基序。PCDHGA3 具有信号肽、4 个假定的 N 连接糖基化位点和 6 个钙粘蛋白胞外域。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Wu 等人(2001) 将 PCDHGA3 基因对应到染色体 5q31,位于 PCDHGA2 基因(606289) 和 PCDHGB1 基因(606299) 之间。他们将小鼠 PCDHG 基因定位到染色体 18c。