跨膜蛋白 237; TMEM237
ALS2 染色体区域基因 4;ALS2CR4
HGNC 批准的基因符号:TMEM237
细胞遗传学位置:2q33.1 基因组坐标(GRCh38):2:201,620,186-201,643,503(来自 NCBI)
▼ 说明
TMEM237 是一种位于睫状过渡区的四跨膜蛋白,预计其在经典和非经典 Wnt(参见 164820)信号传导中与其他过渡区蛋白一起发挥作用(Huang 等,2011)。
▼ 克隆与表达
黄等人(2011) 鉴定了 2 个 TMEM237 剪接变体,包括外显子 1 或外显子 2,并被翻译成 2 种不同的蛋白质亚型。Transcript-1 包含外显子 1,编码推导的 408 个氨基酸的蛋白质,称为同种型 A,具有长的 N 端结构域,随后是 4 个跨膜结构域和短的 C 端尾部。N 端和 C 端结构域均位于细胞内。N 端结构域和跨膜螺旋之间的细胞内环含有碱性(arg 和/或 lys)和酸性(asp 和/或 glu)残基的短重复基序,这些基序在后生动物中高度保守。极化纤毛小鼠内髓质管(IMCD3) 细胞的免疫细胞化学染色显示,Tmem237 定位于初级纤毛近端区域的过渡区。
Zuniga 和 Craft(2010) 克隆了小鼠 Tmem237,他们将其称为 Als2cr4,并鉴定了编码 2 个仅在极端 N 末端不同的蛋白质亚型的变体。由Als2cr4transcript-2编码的推导的403个氨基酸的蛋白质的计算分子量约为45kD,与人ALS2CR4的亚型A和B分别具有81%和82%的同一性。Als2cr4 具有一个包含四肽基序的长 N 端结构域,随后是 4 个跨膜片段和一个短的 C 端尾部。Zuniga 和 Craft(2010) 指出,之前的原位杂交和基因表达谱显示 Als2cr4 在眼睛、海马体、小脑和嗅球中高表达。通过对视网膜的免疫组织化学分析,Zuniga 和 Craft(2010) 发现 Als2cr4 在视网膜中富集,并定位于感光器外节、睫状复合体和外丛状层中的水平细胞。免疫电镜验证了光感受器外节圆盘中 Als2cr4 的表达。
▼ 基因功能
通过对小鼠视网膜进行酵母 2 杂交分析,Zuniga 和 Craft(2010) 发现 Als2cr4 与 Arr4(ARR3; 301770) 相互作用。光适应小鼠视网膜的免疫沉淀分析表明 Als2cr4 与细胞骨架成分相关。Als2cr4 直接与肌球蛋白 Va(MYO5A; 160777)、肌球蛋白 VI(MYO6; 600970) 和 Arr3 相互作用。
黄等人(2011) 发现通过小干扰 RNA 敲低 IMCD3 细胞中的 Tmem237 会损害纤毛发生,并导致 RhoA(165390) 错误定位到基底体的外围区域和基底外侧细胞-细胞接触。同样,来自 Joubert 综合征 14(JBTS14;614424) 和 TMEM237 无效突变(R18X;614423.0001) 患者的成纤维细胞显示规范和非规范 Wnt 信号传导失调以及 RHOA 错误定位。在斑马鱼中吗啡啉介导的 Tmem237 敲低会导致与纤毛功能障碍一致的原肠胚形成缺陷,这与敲低其他过渡区蛋白(包括 Mks3(TMEM67; 609884) 和 Tmem216(613277))导致的缺陷相似。斑马鱼的这些缺陷可通过表达人 TMEM237、MKS3 或 TMEM216 部分逆转。在 IMCD3 细胞和线虫中,Tmem237 的过渡区定位依赖于其他过渡区蛋白。黄等人(2011) 假设 TMEM237、TMEM216 和 MKS3 作为调节纤毛发生和 WNT 信号传导的模块。
▼ 基因结构
黄等人(2011) 确定 TMEM237 基因包含 14 个外显子,跨度为 23 kb。
▼ 测绘
Zuniga 和 Craft(2010) 指出,人类 TMEM237 基因对应到染色体 2q33.2,而 miR 直系同源物对应到染色体 1。
▼ 分子遗传学
通过纯合性作图,然后对 10 个患有 Joubert 综合征(JBTS14;614424) 的加拿大 Hutterite 家族进行候选基因分析,Huang 等人(2011) 鉴定了 TMEM237 基因中的纯合截短突变(R18X; 614423.0001)。在另外 3 个患有该疾病的家族中也发现了纯合子或复合杂合子突变(614423.0002-614423.0005)。预计所有突变都会导致无效等位基因。患者细胞的蛋白质提取物显示非经典 WNT 通路受到干扰,DVL1(601365) 发生组成型磷酸化和过度激活,CTNNB1(116806) 水平增加。RHOA 信号传导也有所增加。该表型的特点是严重智力低下、婴儿期呼吸模式异常、脑成像显示磨牙征、肾囊肿、眼球运动异常以及许多患者过早死亡。
▼ 等位基因变异体(5 个精选示例):
.0001 朱伯特综合症 14
TMEM237,ARG18TER(rs199469707)
在 10 个加拿大 Hutterite 家族的受影响成员中,患有 Joubert 综合征 - 14(JBTS14; 614424)(Boycott 等人,2007),Huang 等人(2011) 鉴定了 TMEM237 基因中的纯合 52C-T 转换,导致 arg18 到 ter(R18X) 取代。对正常哈特派对照的筛选显示该突变的携带频率为 6%。在超过 105 个北欧对照中未发现该突变。患者成纤维细胞中的 TMEM237 转录水平降低了 99.6%,并且与对照细胞相比,这些细胞显示出纤毛发生和中心粒配对缺陷。
冲等人(2012) 在美国的 Schmiedeleut(S-leut) Hutterites 中确定了这种突变的携带频率为 0.080(12.5 分之一)。这种突变是哈特派人群所独有的。
.0002 朱伯特综合症 14
TMEM237,IVS9DS,GT,+1
在患有 Joubert 综合征 14(JBTS14; 614424) 的奥地利近亲家庭的受影响成员中(Janecke 等人,2004 年),Huang 等人(2011) 在 TMEM237 基因的内含子 9(677+1G-T) 中鉴定出纯合的 G 到 T 颠换。对患者成纤维细胞的 RT-PCR 分析和测序显示出 2 种异常转录本:一种导致 65 个氨基酸缺失并插入丝氨酸残基,另一种导致外显子 9 跳过并提前终止。患者成纤维细胞中的 TMEM237 转录水平降低了 98.4%,并且与对照细胞相比,这些细胞显示出纤毛发生和中心粒配对缺陷。
.0003 朱伯特综合症 14
TMEM237,1-BP DUP,1066C
Huang 等人在一名患有 Joubert 综合征 14(JBTS14; 614424) 的近亲父母出生的约旦儿童中(2011) 在 TMEM237 基因的外显子 13 中发现了纯合 1-bp 重复(1066dupC),预计会导致移码和提前终止。在超过 105 名约旦对照者中未发现该突变。
.0004 朱伯特综合症 14
TMEM237, GLN26TER
在一名患有 Joubert 综合征 14(JBTS14; 614424) 的欧洲和西班牙血统儿童中,Huang 等人(2011) 鉴定了 TMEM237 基因中 2 个突变的复合杂合性:母系遗传的 76C-T 转换,导致 gln26-to-ter(Q26X) 取代,以及父系遗传的内含子 11 中的 G-to-T 颠换(943 +1G-T;614423.0005),导致 56 个氨基酸(外显子 11 和 12)的框内缺失。在超过 105 个对照中未发现突变。
.0005 朱伯特综合症 14
TMEM237,IVS11DS,GT,+1
讨论黄等人在 Joubert 综合征 14(JBTS14; 614424) 患者的复合杂合状态下发现的 TMEM237 基因(943+1G-T) 剪接位点突变(2011),参见 614423.0004。