核孔相关蛋白 1; NPAP1
染色体 15 开放解读码组 2; C15ORF2
HGNC 批准的基因符号:NPAP1
细胞遗传学位置:15q11.2 基因组坐标(GRCh38):15:24,675,775-24,683,393(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Farber 等人通过对染色体 15 上 Prader-Willi 综合征(PWS; 176270) 关键区域中含有 CpG 岛的 YAC 克隆进行测序,然后进行数据库分析以及人类睾丸 cDNA 文库的 PCR 和 3-prime RACE(2000)克隆了C15ORF2。推导的蛋白质含有1,156个氨基酸。Northern 印迹分析在成人睾丸中检测到 7.5 kb 的转录物,但在胎儿睾丸或任何其他检查的成人或胎儿组织中未检测到。Southern 印迹分析在几种灵长类动物中检测到了 C15ORF2,但在所检查的任何其他哺乳动物或鸟类物种中均未检测到。灵长类动物序列具有 97% 至 99% 的同一性。
▼ 基因功能
法伯等人(2000) 发现与 C15ORF2 相关的 CpG 岛在除生殖细胞之外的所有测试组织中均被甲基化。尽管 C15ORF2 位于印记基因 MAGEL2(605283) 和 SNRPN(182279) 之间,但他们证明 C15ORF2 在成人睾丸中双等位表达。
布廷等人(2007) 发现 C15ORF2 在胎儿大脑中单等位基因表达。
▼ 基因结构
法伯等人(2000) 确定 C15ORF2 是一个无内含子基因,其起始密码子嵌入 CpG 岛内。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Farber 等人(2000) 将 C15ORF2 基因对应到染色体 15q11-q13。Southern blot分析表明C15ORF2是一个单拷贝基因。