蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体型,14; PTPN14
具有 Ezrin 结构域的磷酸酶;PEZ
HGNC 批准的基因符号:PTPN14
细胞遗传学位置:1q32.3-q41 基因组坐标(GRCh38):1:214,348,700-214,551,602(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
蛋白质酪氨酸磷酸化受蛋白质酪氨酸激酶(PTK) 和蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTP) 的活性调节。Smith 等人利用基于 PTP 催化结构域保守区域的简并寡核苷酸引物对乳腺 mRNA 进行 RT-PCR(1995) 分离出编码 PTPN14 的 cDNA,他们将其称为 PEZ。预测的 1,187 个氨基酸蛋白的结构与 PTPH1(176877)、PTPN4(176878) 和 PTPD1(603271) 的结构相似,因为它包含 C 端 PTP 样结构域和 N 端埃兹蛋白(123900) ) 类域。作者将基因 PEZ 指定为“具有埃兹蛋白结构域的磷酸酶”。与 PTPD1 一样,PEZ 在埃兹蛋白样结构域和催化结构域之间的区域中包含一个酸性区域和一个推定的 SH3 结构域结合序列。Northern 印迹分析显示,PEZ 在多种组织中表达,但在脑或肝脏中不表达。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交,Smith 等人(1995) 将 PTPN14 基因对应到染色体 1q32.2-q41。他们发现染色体 1q32 处的 D1S419 多态性标记包含在 PTPN14 基因中,从而证实了这一定位。
▼ 基因功能
Au 等人利用体外研究(2010) 观察到 PTPN14 与 VEGFR3 共免疫沉淀(136352),并且通过 VEGFC 刺激增强了相互作用(601528)。这些结果表明,VEGFC 介导的信号传导可能会增强 PTPN14 向蛋白质复合物的募集,该蛋白质复合物包括 VEGFR3(一种淋巴管生成必需的受体酪氨酸激酶)。
▼ 分子遗传学
后鼻孔闭锁和淋巴水肿
Au 等人在患有后鼻孔闭锁和淋巴水肿的也门近亲家庭成员中(CATLPH; 613611)(2010) 鉴定出 PTPN14 基因(603155.0001) 中的纯合缺失。没有患者患有癌症。
Bordbar 等人在患有双侧后鼻孔闭锁和淋巴水肿的患者中(2017) 在 PTPN14 基因(603155.0002) 中检测到纯合移码突变。
癌症中的体细胞突变
王等人(2004) 对人类癌症中的酪氨酸磷酸酶基因超家族进行了突变分析,并鉴定了 6 种蛋白质酪氨酸磷酸酶中的 83 个体细胞突变(PTPRF,179590;PTPRG,176886;PTPRT,608712;PTPN3,176877;PTPN13,600267;和 PTPN14) ),影响 26% 的结直肠癌以及一小部分肺癌、乳腺癌和胃癌。十五种突变是无义突变、移码突变或剪接位点改变,预计会导致缺乏磷酸酶活性的截短蛋白质。王等人(2004) 通过生化检查了 PTPRT(最常见的蛋白质酪氨酸磷酸酶改变)中的 5 个错义突变,发现它们降低了磷酸酶活性。野生型而非突变型 PTPRT 在人类癌细胞中的表达抑制了细胞生长。王等人(2004) 得出的结论是,他们的观察表明突变的酪氨酸磷酸酶是肿瘤抑制基因,调节可能适合治疗干预的细胞途径。
▼ 动物模型
欧等人(2010) 使用基因捕获技术生成 Ptpn14 缺陷的小鼠模型。所有动物均未出现后鼻孔闭锁,但约 14% 的纯合突变动物出现四肢肿胀或眶周水肿。这些小鼠的耳朵毛细淋巴管也出现增生。研究发现,基因捕获技术产生的是低等位基因,而不是真正的无效等位基因,因为突变小鼠的一些组织显示出 Ptpn14 基因的转录。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 后鼻孔闭锁和淋巴水肿
PTPN14, 2,016-BP DEL
Au 等人在患有后鼻孔闭锁和淋巴水肿的也门近亲家庭成员中(CATLPH; 613611)(2010) 鉴定了 PTPN14 基因内含子 6 到内含子 7 的纯合 2,016 bp 缺失,导致外显子 7 丢失、移码和过早终止。预计删除会中断 FERM 结构域,但该蛋白质可能不稳定且催化失活。在 222 个对照染色体中未发现该缺失。
.0002 后鼻孔闭锁和淋巴水肿
PTPN14,2-BP INS,401TT
Bordbar 等人在一名患有双侧后鼻孔闭锁和淋巴水肿(CATLPH; 613611) 的 2 岁伊朗女孩中,是表亲父母的孩子(2017) 检测到 PTPN14 基因外显子 4 中 2 bp 插入(c.401_402TT、NM_005401.4) 的纯合性,导致移码和提前终止(Leu135TyrfsTer5)。该突变是通过直接测序发现的,并且每个亲本都是杂合的。ExAC 或大中东 Variome 项目数据库或内部外显子组测序数据库中未发现该变异。