血红素结合蛋白 2; HEBP2
染色体 6 开放解读码组 34; C6ORF34
SOUL,鸡,同系物;SOUL
HGNC 批准的基因符号:HEBP2
细胞遗传学位置:6q24.1 基因组坐标(GRCh38):6:138,403,531-138,422,197(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
使用双组织消减杂交来识别感兴趣组织(测试者)和对照组织(驱动者)之间的差异表达基因,然后通过抑制 PCR 来扩增在两个测试者组织以及 5-prime RACE、Zylka 和 Reppert 中表达的转录本(1999) 鉴定了一种编码鸡蛋白的 cDNA,他们将其命名为 Soul。Northern 印迹和 RT-PCR 分析显示,3.0-和 4.0-kb Soul 转录本在松果体中高表达,这是由选择性剪接产生的,在视网膜中表达较低,在其他组织中没有表达。作者将这个基因命名为“灵魂”,因为它在松果体中高表达,勒内·笛卡尔假设该器官是灵魂的所在地。通过 EST 数据库搜索鸡 Soul 的同源物,Zylka 和 Reppert(1999) 鉴定了编码血红素结合蛋白(HBP; 605826) 和 SOUL 的小鼠和人类 cDNA。序列分析预测,由 205 个氨基酸组成的人类 SOUL 蛋白与小鼠序列 80% 相同,不包含像 HBP 中那样的保守疏水血红素结合区域。Northern 印迹分析在小鼠眼中检测到 1.5 kb Soul 转录本。共聚焦显微镜表明,小鼠Soul的表达主要是细胞质,并有一些核周定位。
Liu 和 McKeehan(2002) 使用 LRPPRC(607544) 的 SEC1 同源结构域作为酵母 2 杂交筛选中的诱饵,从肝脏 cDNA 文库中克隆了 HEBP2。他们还鉴定了一种由外显子跳跃产生的变体,其中包含氨基酸 12 至 36 的缺失。HEBP2 与细菌转录因子具有序列和结构相似性。Northern 印迹分析显示 1-kb 转录物普遍表达,在心脏、骨骼肌、肾脏和肝脏中表达水平最高,在脑、结肠、小肠、胎盘、肺和外周血白细胞中表达中等水平,在胸腺和脾脏。
▼ 测绘
Scott(2001) 根据 SOUL 序列(GenBank AF117616) 和染色体 6 克隆(GenBank AL031003) 之间的序列相似性,将 SOUL 基因对应到染色体 6q24。