真核起始因子 6; EIF6
整联蛋白,β-4,结合蛋白;ITGB4BP
p27, β-4 整联蛋白-结合蛋白; p27BBP
真核起始因子 3A; EIF3A
HGNC 批准的基因符号:EIF6
细胞遗传学位置:20q11.22 基因组坐标(GRCh38):20:35,278,906-35,284,772(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
整联蛋白 β-4 子单元(ITGB4; 147557) 在半桥粒中高度富集,这种特殊结构在基底层和中间丝细胞骨架之间提供牢固的机械连接。ITGB4 胞质结构域的 303 个氨基酸片段包含前 2 个 N 端纤连蛋白 III 型(FNIII) 结构域及其互连序列,对于介导 ITGB4 信号传导事件和掺入半桥粒是必需的。Biffo 等人使用酵母 2-杂交系统来鉴定与 ITGB4 细胞结构域的该功能区域相互作用的多肽(1997) 分离出编码 ITGB4 结合蛋白(ITGB4BP) 的人上皮细胞 cDNA,他们将其称为 p27BBP。Southern印迹分析表明,人类基因组含有ITGB4BP基因的单个拷贝。Northern印迹分析和原位杂交在所有检查的小鼠组织中均检测到Itgb4bp mRNA,其中含量最高的主要是增殖上皮细胞和含有Itgb4的上皮组织。预测的人类ITGB4BP蛋白有245个氨基酸并且缺乏信号序列。使用抗 ITGB4BP 抗体进行蛋白质印迹分析,在上皮细胞裂解物中检测到 27-kD 蛋白质,这与计算的 ITGB4BP 分子量一致。在酵母和体外,ITGB4BP 特异性结合 ITGB4 的前 2 个 FNIII 结构域。ITGB4BP 是一种不溶性蛋白质,存在于细胞核和细胞质中。它与中间丝池相关,并且位于与 ITGB4 紧密相连的亚膜水平。作者认为 ITGB4BP 将 ITGB4 连接到中间丝细胞骨架。
真核起始因子 6(EIF6) 与 60S 核糖体子单元结合并阻止其与 40S 核糖体子单元结合。Si 等人使用针对纯化的兔 EIF6 蛋白的抗体对 HeLa 细胞 cDNA 表达文库进行免疫筛选(1997)分离出编码EIF6的cDNA。Northern 印迹分析在所有检查的人体组织中检测到大约 1.1 kb 的转录物。
▼ 基因功能
塞西等人(2003) 证明核糖体 60S 子单元通过 EIF6 的释放而被激活。在细胞质中,EIF6 与游离 60S 结合,但不与 80S 子单元结合。此外,EIF6 在细胞质中与 RACK1(176981) 相互作用,RACK1(176981) 是活化蛋白激酶 C(PKC;参见 176960) 的受体。RACK1 是翻译核糖体的主要组成部分,其中含有大量 PKC。用 EIF6 加载 60S 子单元会引起剂量依赖性的转录阻断和 80S 形成的损害,而 RACK1 的表达和体内和体外的 PKC 刺激可逆转这种情况。PKC 刺激导致 EIF6 磷酸化,并且 EIF6 羧基末端丝氨酸残基突变,损害了 RACK1/PKC 介导的转录救援。塞西等人(2003)提出EIF6的释放调节子单元的连接,并且RACK1提供PKC信号传导和核糖体激活之间的物理和功能联系。
为了阐明 microRNA 如何介导其抑制作用,Chendrimada 等人(2007) 进行了生化和功能测定,以确定 microRNA 途径中的新因子。陈德里马达等人(2007) 表明人类 RISC(RNA 诱导沉默复合物)与含有 MOV10(610742) 的多蛋白复合物相关,MOV10(610742) 是果蝇转录抑制子 Armitage 的同源物,以及 60S 核糖体子单元的蛋白质。值得注意的是,该复合物含有抗结合因子 EIF6,这是一种核糖体抑制蛋白,已知可阻止 80S 核糖体的有效组装。人类细胞中 EIF6 的缺失特异性地消除了 miRNA 介导的靶蛋白和 mRNA 水平的调节。同样,线虫中 EIF6 的缺失减弱了 Lin4 microRNA 介导的内源性 Lin14 和 Lin28(611043) 靶蛋白和 mRNA 水平的抑制。陈德里马达等人(2007) 得出的结论是,他们的结果揭示了核糖体抗结合因子 EIF6 在 microRNA 介导的转录后沉默中的进化保守功能。
甘丁等人(2008) 证明哺乳动物 eIF6 是体内有效启动转录所必需的。Eif6-null小鼠胚胎在植入前是致命的。杂合子小鼠所有组织中的 eIF6 水平降低了 50%,并且由于细胞数量减少和 G1/S 细胞周期进程受损,肝和脂肪组织质量减少。eIF6 杂合细胞保留了足够的核仁 eIF6 和正常的核糖体生物合成。eIF6杂合小鼠的肝脏多聚体谱增加了80S,表明转录起始存在缺陷。一致地,孤立的肝细胞的胰岛素刺激的转录受损。杂合的胚胎成纤维细胞再现了生物体表型,具有正常的核糖体生物发生、胰岛素刺激的减少和延迟的 G1/S 期进展。此外,eIf6杂合细胞对癌基因诱导的转化具有抵抗力。因此,甘丁等人(2008) 得出结论,eIF6 是第一个与大型 60S 子单元相关的 eIF,该 60S 子单元调节响应细胞外信号。
德马科等人(2017) 指出 Eif6 过度表达会延迟非洲爪蟾眼睛的发育。他们发现,在非洲爪蟾 Eif6 过表达表型中,Eif6 与 Igf1r(147370) 相互作用并抑制 PI3K 通路(参见 171833)。Eif6 过度表达后眼睛形态发生延迟可以通过 Igf1r 相互作用因子 Gipc2(619089) 的表达来逆转,并且 Gipc2 下调也导致爪蟾眼睛形态发生延迟。Eif6与Gipc2相互作用并以剂量依赖性方式调节其表达,从而调节爪蟾眼睛的形态发生。Gipc2 的 PDZ 结构域介导与 Eif6 的相互作用,并且是 Gipc2 功能所必需的。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交,Sanvito 等人(1998) 将 ITGB4BP 基因对应到 20q11.2。