CKLF 样 MARVEL 跨膜结构域 1; CMTM1
趋化因子样因子超家族,成员 1;CKLFSF1
HGNC 批准的基因符号:CMTM1
细胞遗传学位置:16q21 基因组坐标(GRCh38):16:66,566,439-66,579,135(来自 NCBI)
▼ 说明
趋化因子样因子超家族的成员(包括 CKLFSF1)与信号分子的趋化因子(参见 604852)和跨膜 4(参见 300191)超家族具有相似性。
▼ 克隆与表达
Han 等人通过筛选数据库中与趋化因子样因子(CKLF; 616074) 具有同源性的序列,然后对睾丸 cDNA 文库进行 RT-PCR(2003)克隆了CKLFSF1。CKLFSF1 基因编码至少 23 个可变剪接异构体。一种变体编码一种 169 个氨基酸的蛋白质,该蛋白质具有 CC 趋化因子基序和 4 个跨膜片段。CKLFSF1 与 CKLF、CKLFSF2(607885) 和 CKLFSF7(607890) 具有最相似的相似性。CKLFSF1 的 N 末端与 CCL17(601520) 具有相似性,C 末端与 CCL22(602957) 和 fractalkine(CX3CL1; 601880) 具有相似性。Northern 印迹分析检测到在睾丸中高表达的 1.14 kb 转录物。在白细胞和胎盘中未检测到表达。韩等人(2003) 还克隆了小鼠 Cklfsf1,其 C 端与 CKLFSF1 具有 50% 的序列相似性。
▼ 基因结构
徐等人(2004) 发现 CMTM1 的启动子位于下游基因 CKLF(616074) 的最后一个内含子中。启动子包含一个典型的TATA框和多个转录因子结合位点。诱饵和荧光素酶分析证实了启动子的功能。Northern blot和RT-PCR分析表明,仅相隔325 bp的CKLF和CMTM1孤立表达。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Han 等人(2003) 将 CKLFSF1 基因对应到染色体 16q22,它与 CKLF、CKLFSF2(607885)、CKLFSF3(607886) 和 CKLFSF4(607887) 基因位于紧密的基因簇内。他们将小鼠 Cklfsf1 基因对应到染色体 8,并嵌入到类似的基因簇中。