长基因间非编码 RNA 237; LINC00237
lincRNA 237
HGNC 批准的基因符号:LINC00237
细胞遗传学位置:20p11.23 基因组坐标(GRCh38):20:21,087,604-21,106,358(来自 NCBI)
▼ 说明
长链非编码 RNA,例如 LINC00237,预计可调节基因表达(Vu et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
通过在患有巨大儿、肥胖、大头畸形和眼部异常(MOMO) 综合征(157980) 的患者(157980) 中寻找因 at(16;20)(q21;p11.2) 易位而破坏的染色体 20 区域中的基因,然后进行 PCR和正常人淋巴母细胞的 RACE,Vu 等人(2012) 克隆了 LINC00237 的 2 个剪接变体,它们的第一个外显子有所不同。含有外显子1-α的转录物长368个核苷酸,含有外显子1-β的转录物长480个核苷酸。外显子 2 包含假定的 36 个氨基酸阅读框,但缺乏共有的 Kozak 序列。RT-PCR 分析检测到 LINC00237 在正常人脑中高表达,在淋巴母细胞中表达较弱,在成纤维细胞或脂肪细胞中无表达。数据库分析揭示了一个与人类 LINC00237 具有 87% 相似性的 小鼠直系同源物。
▼ 基因结构
武等人(2012) 确定 LINC00237 基因包含 3 个外显子,跨度为 12.8 kb。前 2 个外显子 1-α 和 1-β 交替剪接到外显子 2 上。
▼ 测绘
使用 FISH,Vu 等人(2012) 将 LINC00237 基因对应到染色体 20p11.23。