MIR99A-LET7C 簇宿主基因,非编码; MIR99AHG
巨核细胞致癌非编码RNA;MONC
长基因间非编码 RNA 478;LINC00478
lincRNA 478
HGNC 批准的基因符号:MIR99AHG
细胞遗传学位置:21q21.1 基因组坐标(GRCh38):21:16,070,488-16,631,727(来自 NCBI)
▼ 说明
MIR99AHG 被转录为多顺反子初级转录物,产生剪接的长基因间非编码 RNA(lincRNA) 和 3 个内含子 microRNA(miRNA):MIR99A(614509)、MIR125B2(610105) 和 LET7C(MIRLET7C; 612144)。MIR99AHG lincRNA 在细胞增殖和分化中发挥作用(Emmrich et al., 2014)。
▼ 克隆与表达
埃姆里奇等人(2014) 报道称 MIR99AHG(他们称之为 MONC)被剪接成 710 个核苷酸的 lincRNA。MONC 的内含子 6 产生 miRNA MIR99A、LET7C 和 MIR125B2。MONC 及其 3 个内含子 miRNA 在系统发育上是保守的。定量 RT-PCR 分析检测到与其他血细胞谱系相比,巨核细胞、造血干细胞(HSC) 和 B 细胞中 MONC 表达较高。与其他白血病细胞系相比,MONC 以及同源 lincRNA 和 miRNA 宿主基因 MIR100HG(615965) 在急性巨核细胞白血病(AMKL) 细胞系中均高度表达。然而,每个宿主基因的成熟 LET7 旁系同源物的表达与剪接转录本的表达不相关,表明 LET7 的表达受到抑制。RNA FISH 在 AMKL 细胞系的点状核分布中检测到 MONC 和 MIR100HG。
▼ 基因功能
埃姆里奇等人(2014) 发现,在具有高内源性 MONC 表达的 AMKL 细胞系中敲低 MONC 会降低细胞生长和集落形成能力。MONC 的敲除还诱导细胞凋亡并以细胞系依赖性方式改变巨核细胞-红细胞表面标记。MONC 的敲低降低了原代 AMKL 细胞的集落形成能力。MONC 的过度表达诱导 HSC 向红系祖细胞谱系转变。
▼ 基因结构
埃姆里奇等人(2014) 确定 MIR99AHG 有 8 个外显子,转录起始位点位于外显子 1、4 和 6。内含子 6 是 MIR99A、MIRLET7C 和 MIR125B2 的宿主。
▼ 测绘
埃姆里奇等人(2014) 报道 MIR99AHG 基因对应到染色体 21。
Hartz(2014) 根据 MIR99AHG 序列(GenBank AA451643) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 MIR99AHG 基因对应到染色体 21q21.1。