聚合酶、DNA、MU; POLM
HGNC 批准的基因符号:POLM
细胞遗传学定位:7p13 基因组坐标(GRCh38):7:44,072,062-44,082,530(来自 NCBI)
▼ 说明
POLM是一种模板依赖性DNA聚合酶,与淋巴特异性酶末端脱氧核苷酸转移酶(TDT)密切相关;187410)。POLM 似乎参与了免疫球蛋白(Ig)基因重排过程中 DNA 末端的加工(Bertocci et al., 2003)。
▼ 克隆与表达
通过搜索序列数据库来鉴定polX家族的新成员,Aoufouchi等人(2000)鉴定了代表2种DNA聚合酶POLM和POLL(606343)的EST克隆,他们分别将其称为pol mu和pol lambda。他们通过筛选骨髓和淋巴结 cDNA 文库并使用 5-prime RACE 克隆了全长 POLM cDNA。POLM 编码一个推导的 494 个氨基酸的蛋白质,包含 polX 结构域、BRCA-1 C 端(BRCT)结构域和 2 个螺旋-发夹-螺旋(HHH)DNA 结合基序。POLM 与 TDT 具有 40% 的氨基酸同一性,与 小鼠 Polm 具有 76% 的氨基酸同一性。Northern 印迹分析在多种组织中检测到 2.5 kb POLM 转录物,其中淋巴组织(包括胸腺和扁桃体 B 细胞)中水平最高。Aoufouchi等(2000)推测POLM可能在增殖的淋巴细胞中优先表达。他们使用 RT-PCR 扩增 POLM cDNA 序列,鉴定出几种不编码功能蛋白的 POLM 剪接变体。编码完整蛋白质的 mRNA 是一个较小的种类,约占细胞中存在的 mRNA 的 10%。
Bertocci et al.(2003)利用Northern blot分析发现,除淋巴组织外,小鼠Polm在多种组织中高表达,包括皮肤和大脑。它在睾丸中表现出低表达,睾丸是许多修复或跨损伤 DNA 聚合酶强烈表达的组织。
▼ 基因结构
Aoufouchi 等人(2000)确定 POLM 由 11 个外显子编码,跨越大约 10 kb 的基因组 DNA。它具有相同的外显子/内含子组织,结构上类似于 TDT。
▼ 测绘
Gross(2014)根据POLM序列(GenBank AF176097)与基因组序列(GRCh38)的比对,将POLM基因定位到染色体7p13。
▼ 基因家族
Aoufouchi 等人(2000)对 polX 家族的酵母和人类蛋白进行了系统发育比较。
▼ 基因功能
Aoufouchi等人(2000)发现POLM在体外具有模板依赖性DNA聚合酶活性。使用半定量 RT-PCR 扩增,他们发现当细胞暴露于 DNA 损伤剂时,POLM mRNA 表达以剂量和时间依赖性方式下调。
▼ 动物模型
Bertocci et al.(2002)产生了缺乏 Polm 的可存活且具有生育能力的小鼠。Polm -/- 小鼠表现出正常的超突变模式,但组织学分析表明,一半的 Polm -/- 小鼠外周淋巴器官中的 B 细胞明显减少,其中脾脏 B 细胞减少了 50%。
Bertocci et al.(2003)利用FACS分析证明了Ig kappa轻链(IGKC;147200)-阳性,但不是Ig lambda轻链(IGLC; 147220)-Polm -/- 小鼠中的阳性脾 B 细胞。免疫组织化学分析显示派尔集结 B 细胞数量减少,且生发中心区室化缺失。Polm -/- 小鼠改变了骨髓中 B 细胞从 IgM 阴性向 IgM 阳性的转变。V-kappa-J-kappa 和 V-lambda-J-lambda 连接处的 Ig 轻链基因排列受损,B 细胞互补决定区 3(CDR3)的核苷酸数量减少,但不是 T 细胞。Bertocci et al.(2003)得出结论,POLM是导致轻链CDR3大小相对同质性的关键元件,并且在TDT不再表达的阶段参与Ig基因重排。