前 mRNA 加工因子 40 同源物 A；PRPF40A

前体 mRNA 加工因子 40，酿酒酵母，A 的同源物
PRPF40，酿酒酵母，A 的同源物
亨廷顿蛋白相互作用蛋白 A；HYPA
形式结合蛋白 3；FNBP3
FBP11, 小鼠, 同源; FBP11

HGNC 批准的基因符号：PRPF40A

细胞遗传学定位：2q23.3 基因组坐标（GRCh38）：2:152,651,732-152,718,019（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

亨廷顿病（HD；143100）是由编码亨廷顿蛋白（HTT；HTT；613004）超过34台。Faber等人（1998）在睾丸cDNA文库的酵母2-杂交筛选中使用含有58或62个谷氨酰胺的亨廷顿蛋白的N端结构域克隆了PRPF40A，他们将其命名为HYPA。推导的蛋白与福尔明（FMN1;）Fbp11同源。136535）-结合WW结构域蛋白，参与剪接体功能。数据库分析揭示了另外 2 个 HYPA 剪接变体。Northern 印迹分析在所有检查的成人和胎儿组织中检测到约 4.2 kb 的主要 HYPA 变体。3.4 至 3.7 kb、7.2 kb 和 7.9 kb 的其他转录物显示出组织特异性表达。在成人睾丸以及胎儿肾、肝和肺中检测到最高的 HYPA 表达。

Katoh和Katoh（2003）利用小鼠Fnbp3查询数据库，鉴定出人类PRPF40A的2个剪接变体，他们将其称为FNBP3。Variant-1 编码推导的 957 个氨基酸的蛋白质，Variant-2 编码推导的 915 个氨基酸的蛋白质，该蛋白质在 N 末端附近缺少 42 个氨基酸的序列。两种蛋白均含有 2 个 WW 结构域、2 个 FF 结构域和一个二分核定位信号。两者还包含 FF 结构域之间和 C 末端附近的进化保守序列。EST 数据库分析表明，variant-2 是主要转录本。

Sayer等人（2005）利用Western blot分析，在纯化的人脑核基质组分中检测到表观分子质量为140 kD的HYPA。

▼ 基因功能

Faber等人（1998）表明HYPA在HD淋巴母细胞中结合亨廷顿蛋白。这种相互作用是由亨廷顿蛋白富含脯氨酸的区域介导的，并通过邻近的聚谷氨酰胺束的延长而增强。

Sayer等人（2005）利用酵母2-杂交筛选发现，小鼠Hypa与人核支架蛋白NAKAP（AKAP8L）相互作用；609475）。缺失图谱表明结合是通过 NAKAP 的富含脯氨酸的结构域和 Hypa 的 WW 结构域发生的。在人胚胎肾细胞中，NAKAP 和 HYPA 位于细胞核内并与核基质共纯化。NAKAP 与正常人脑中的 HYPA 相关，并且这两种蛋白与 HD 脑中的亨廷顿蛋白的一部分共纯化。

▼ 生化特征

FF 结构域以 2 个高度保守的苯丙氨酸残基命名，长约 60 个氨基酸，可结合磷酸化蛋白质。Allen等人（2002）利用NMR发现人类HYPA的第一个FF结构域折叠成3个排列成正交束的α螺旋。保守的苯丙氨酸位于螺旋 1 和 3 的中间，形成蛋白质疏水核心的一部分。该FF结构域结合RNA聚合酶II大子单元（POLR2A;）的2个磷酸化C端结构域重复序列（CTD）180660），但它不结合非磷酸化的CTD。

▼ 基因结构

Katoh and Katoh（2003）确定PRPF40A基因包含26个外显子，跨度约62 kb。

▼ 测绘

Katoh and Katoh（2003）通过基因组序列分析，将PRPF40A基因定位到染色体2q23.3。