刺平面细胞极性蛋白 3; PRICKLE3
刺果蝇,果蝇,同源物,3
刺状 3
仅 LIM 域 6;LMO6
HGNC 批准的基因符号:PRICKLE3
细胞遗传学定位:Xp11.23 基因组坐标(GRCh38):X:49,174,802-49,186,373(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
在对 X 染色体基因丰富区域的研究中,Fisher 等人(1997)发现了一个新基因 PRICKLE3,他们将其称为 LMO6。LMO6 预计编码 407 个氨基酸的产物,与含有 LIM 结构域的蛋白质具有显着同源性,特别是小鼠 testin(TES; 606085)。LIM 结构域是富含半胱氨酸的序列基序,可结合锌原子,在蛋白质-蛋白质相互作用中形成特定的蛋白质结合界面。与 testin 一样,LMO6 产品包含 3 个这样的域。Fisher 等人(1997)使用 RT-PCR,从淋巴母细胞 RNA 中扩增出跨越 LMO6 转录物外显子 5 至 7 的 450 bp 产物。这证实了 LMO6 基因座已被转录并且不太可能是假基因。
在 HeLa 细胞中瞬时表达 HA 标记的 PRICKLE3 后,Yu 等人(2020)进行了细胞级分实验,揭示了线粒体级分以及细胞质中外源 PRICKLE3 的富集。作者还观察到 Prickle3 在小鼠组织和小鼠视网膜各层中普遍表达,以及在小鼠胚胎成纤维细胞线粒体中的定位。
▼ 基因结构
Fisher et al.(1997)确定PRICKLE3基因含有8个外显子。
▼ 测绘
Fisher et al.(1997)将PRICKLE3基因定位到染色体Xp11.23-p11.22,位于A4(300112)和SYP(313475)基因之间12.5kb的间隔内。
▼ 基因功能
Yu et al.(2020)在HEK293T细胞系中证明了PRICKLE3和ATP合酶-8(MTATP8; 516070)相互免疫沉淀。PRICKLE3不沉淀ATP5A(ATP5F1A;164360), ATP5B(ATP5F1B; 102910), ATP5F(ATP5PB; 603270)、ATPAF1(608917)或UQCRC2(191329),表明PRICKLE3通过特异性结合ATP8直接与ATP合酶相互作用。
▼ 分子遗传学
3个中国母系遗传莱伯视神经萎缩(LOAM;Yu et al.(2020) 鉴定了 PRICKLE3 基因(R53W; 308905)中的错义突变(R53W;308905)和 MTND4 基因中的 LHON11778A 变异(516003.0001)的杂合性 300111.0001)。所有受影响的个体均携带 MTND4 和 R53W 突变;仅具有单一突变的个体视力正常。作者指出,同时携带 R53W 和 LHON11778A 突变的 3 个中国家庭比仅携带 LHON 相关 mtDNA 突变的家庭表现出更高的外显率和更年轻的视神经病变发病年龄,并表明 PRICKLE3 突变是一种罕见的变异,可发挥作用作为 X染色体连锁显性易感性等位基因,增加了 LHON 相关 mtDNA 突变的外显率和表达率。
▼ 动物模型
Yu等人(2020)利用CRISPR/Cas9系统生成了Prickle3基因敲除小鼠。酶测定显示,杂合子和半/纯合子小鼠中呼吸复合物 V 的活性分别降低了 52% 和 67%,并且突变小鼠中也存在复合物 V 组装的改变,分别为 59% 和 79%完全组装的 ATP 合酶减少。此外,与野生型小鼠相比,突变型小鼠的 ATP8、ATP6(516060)和 ATP5B 水平出现不同程度的降低。Prickle3 +/- 和 -/- 小鼠的视网膜表现出异常的线粒体形态,包括空泡化、碎片化和嵴缺失。突变小鼠视网膜电图(ERG)显示杂合子和半/纯合子在4周龄时出现视网膜缺陷。视网膜染色切片显示视网膜神经节细胞(RGC)退化,与野生型同窝仔鼠相比,杂合子和纯合子的 RGC 数量分别减少了 22% 和 39%。突变小鼠的视网膜神经丝也比野生型小鼠少得多,杂合子和纯合子小鼠 RGC 上的平均总树突面积分别仅为野生型小鼠的 66% 和 38%。Prickle3 缺陷小鼠中的这种树突修剪得到了蛋白质印迹分析的支持,该分析显示与野生型小鼠相比,突变体中突触后蛋白 Psd95(602887)抗体的水平降低。8 周时 Prickle3 -/+ 和 -/- 小鼠的视网膜血管系统曲折扩张,分支增加。全视野 ERG 显示杂合子和半/纯合子的视网膜功能显着降低,反应仅为野生型小鼠的 24% 至 34%。作者认为,光感受器缺陷是 Prickle3 缺失引起的 RGC 变化的具体表现。
▼ 等位基因变异体(1个精选示例):
.0001 勒伯视神经萎缩,修饰符
PRICKLE3、ARG53TRP
来自 3 个中国家庭(SD1、XT 和 AH)的 23 名患有母系遗传性 Leber 视神经萎缩(LOAM;已知MTND4(516003.0001)中携带LHON11778A变异体(308905),Yu et al.(2020)鉴定了该基因外显子3中c.157C-T转变(c.157C-T, NM_006150)的杂合性或半合性。 PRICKLE3 基因,导致高度保守残基处的 arg53 替换为 trp(R53W)。所有 23 名受影响个体均携带 MTND4 和 R53W 突变;4 名仅携带单一突变的个体视力正常。对携带 R53W 突变(无论有或没有 LHON11778A 变异)的淋巴母细胞系的蛋白质印迹分析显示 PRICKLE3 水平降低了约 55%。显示突变蛋白正常定位于线粒体。对具有一种或两种变体的细胞系中呼吸活性的分析表明,LHON11778A 变体导致复合物 I 的活性降低,而 R35W 降低了复合物 V 的活性。在携带R53W 突变,无论有或没有 LHON11778A 变体,而仅具有 LHON11778A 变体的细胞显示的水平是对照细胞的 95%。对各种突变体和对照细胞系中耗氧率(OCR)的测量表明,仅具有其中一种变体的细胞表现出基础 OCR 和 ATP 相关 OCR 的轻微降低,而在携带两种变体的细胞系中观察到更剧烈的降低。同样,携带两种变体的细胞中 ATP 产量的减少比仅携带其中一种变体的细胞更大。