磷酸甘油酸变位酶家族成员 4;PGAM4
磷酸甘油酸变位酶家族 3;PGAM3
HGNC 批准的基因符号:PGAM4
细胞遗传学定位:Xq21.1 基因组坐标(GRCh38):X:77,967,949-77,969,638(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
磷酸甘油酸变位酶加工基因 PGAM3 最初由 Dierick 等人(1997)在人类中描述为假基因。PGAM3 起源于逆转录转座。亲本基因磷酸甘油酸变位酶1(PGAM1;172250),是位于人类染色体10q25.3上的含内含子基因,而PGAM3不含内含子,位于X染色体上(Dierick et al., 1997;Betran 等,2002)。
Betran等人(2002)从基因组DNA中扩增出了人类和黑猩猩PGAM3基因的完整编码序列,并且还从猕猴中获得了部分基因组序列。序列分析表明编码区不存在插入和缺失,并且替换率表明正选择的作用。已知在 PGAM1 活性酶位点中重要的氨基酸在人类、黑猩猩和猕猴 PGAM3 蛋白中是保守的。
Betran et al.(2002)使用巢式PCR试图从各种cDNA文库中扩增PGAM3。条带是从白细胞 cDNA 文库中获得的,但不是从 HeLa 细胞、人睾丸或人 T 细胞 cDNA 文库中获得的。限制性消化分析证实 PCR 产物代表 PGAM3 而不是 PGAM1。Betran et al.(2002)认为灵长类PGAM3是一个新进化的功能基因而不是假基因。他们表示,人类、黑猩猩和猕猴体内存在 PGAM3 基因,表明该基因至少有 2500 万年的历史。
▼ 基因结构
Dierick et al.(1997)发现PGAM3不含内含子。它在 3-prime UTR 末端的聚腺苷酸化信号后 16 个碱基对处有一个聚(A)尾,并且两侧是 10 bp 的直接重复序列,正如加工基因所预期的那样。
▼ 测绘
Dierick et al.(1997)在染色体Xq13.3上鉴定出人类PGAM3基因位于ATP7A基因(300011)的第一个内含子内,该基因在门克斯病(309400)中发生突变。Betran et al.(2002)发现PGAM3和ATP7A基因在相反的链上编码。