RNA 结合基序蛋白 17;RBM17

剪接因子,45-KD;SPF45

HGNC 批准的基因符号:RBM17

细胞遗传学定位:10p15.1 基因组坐标(GRCh38):10:6,089,034-6,117,447(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Neubauer 等人(1998)描述了哺乳动物剪接体的特征,这是一种从 mRNA 前体中去除内含子的多蛋白复合物。在蛋白质序列数据库中发现了从剪接体的二维凝胶分离中切除的大约一半的成分。使用纳电喷雾质谱法,使用 EST 数据库鉴定并克隆其余部分。所表征的蛋白质之一是 45 kD 剪接因子,作者将其称为 SPF45。

▼ 基因功能

果蝇的“性致死”(Sxl)蛋白促进外显子 3 从其自身的前 mRNA 中跳跃。2 个 AG 二核苷酸的不寻常序列排列和内含子 2 3 引物末端的插入聚嘧啶(Py)区对于 Sxl 自身调节非常重要。Lallena等人(2002)表明U2AF(见191317)与Py道和下游AG相互作用,而SPF45与上游AG相互作用并激活它以进行剪接反应的第二催化步骤。作者表示,SPF45 代表了一类新型的第二步因子,并且发现它与 Sxl 的相互作用可以阻止第二步的剪接。这些结果与其他剪接调节机制形成对比,其他剪接调节机制针对剪接体组装的早期事件。SPF45 在激活由 HBB 基因(141900.0364)中常见突变产生的隐秘 3-prime 剪接位点中也发挥了类似的作用,该突变导致 β-地中海贫血(613985)。

Lim et al.(2008)证明,ATXN1(601556)扩展的多聚谷氨酰胺束在不同的内源蛋白复合物中对宿主蛋白的功能有不同的影响。ATXN1 中的聚谷氨酰胺扩增有利于形成含有 RBM17 的特定蛋白质复合物,通过功能获得机制促进 SCA1(164400)的神经病理学。与此同时,聚谷氨酰胺扩增削弱了另一种含有 ATXN1 和 capicua(612082)的蛋白质复合物的形成和功能,通过部分功能丧失机制促进 SCA1。Lim 等人(2008)得出的结论是,他们的模型为 SCA1 以及其他多聚谷氨酰胺疾病的分子发病机制提供了机制上的见解。

▼ 测绘

RBM17 基因位于染色体 10p15.1,与 IL2RA 基因(147730)的着丝粒 21 kb 处,呈头对头方向(Lowe et al., 2007)。

▼ 分子遗传学

在对多达 5,312 名 1 型糖尿病患者(见 601942)和 6,855 名对照者的分析中,Lowe 等人(2007)将 IL2RA 基因区域中的 1 型糖尿病关联定位于 2 个孤立的 SNP 组,跨越 14 个重叠区域40 kb,包含IL2RA(147730)内含子1和IL2RA的5-prime区域以及侧翼基因RBM17(优势比= 2.04;p = 10(-28))。作者评论说,因果变异不太可能位于 RBM17 本身内,但表示不能排除由于影响转录的基因间区域的多态性而对 RBM17 产生影响。

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