微 RNA 9-1; MIR9-1
MIRN9-1
miRNA9-1
HGNC 批准的基因符号:MIR9-1
细胞遗传学定位:1q22 基因组坐标(GRCh38):1:156,420,341-156,420,429(来自 NCBI)
▼ 说明
微小RNA(miRNA),例如miRNA9,是一种小非编码RNA,通过与3-prime UTR中的反义互补位点结合来控制目标mRNA的转录(Lagos-Quintana et al., 2002)。在人类中,有 3 个基因编码 miRNA9:MIR9-1、MIR9-2(611187)和 MIR9-3(611188)。
▼ 克隆与表达
Lagos-Quintana et al.(2002)克隆了小鼠miRNA9。
▼ 基因功能
Laneve et al.(2007)发现视黄酸在人神经母细胞瘤细胞系中上调 MIRN9、MIRN125A(611191)和 MIRN125B(见 610105)。他们鉴定出编码 t-NTRK3(NTRK3 的截短亚型)的 mRNA(191316)作为 3 个 miRNA 的靶标。t-NTRK3 转录本的 3-prime UTR 有一个 MIRN9 的结合位点,还有一个 MIRN125A 和 MIRN125B 的结合位点,它们共享相同的种子序列。这些 miRNA 以加性方式抑制 t-NTRK3 表达,并且 t-NTRK3 的下调对于调节神经母细胞瘤细胞生长至关重要。与其功能一致,MIRN9、MIRN125A 和 MIRN125B 在原发性神经母细胞瘤中下调。
Plaisance等人(2006)发现神经元和β细胞中表达的MIRN9表达增加会导致葡萄糖刺激的胰岛素释放急剧受损。这种分泌功能的扰动与粒粒蛋白(SYTL4;SYTL4;)水平的增加有关。300723),Rab3/Rab27效应子对胰岛素胞吐作用起负调节作用。Plaisance et al.(2006)鉴定出ONECUT2转录因子(OC2;604894)作为 MIRN9 的靶标,并证明该因子对 granuphilin 表达具有抑制活性。OC2 的沉默模拟了 MIRN9 对刺激诱导的胞吐作用和粒粒蛋白表达的影响。相反,OC2 的过度表达抑制粒粒蛋白的表达。Plaisance 等人(2006)得出结论,适当水平的 MIRN9 对于维持胰岛素分泌细胞中最佳刺激诱导的胞吐作用是必要的。
在 miR 脊椎动物神经系统内的有丝分裂退出点,当细胞失去多能性并开始形成终生持续的稳定连接时,ATP 依赖性染色质重塑机制就会发生转变。本次交换机涉及BAF53A(604958)和BAF45A(PHF10)的互换;613069)Swi/Snf 样神经祖细胞特异性 BAF(npBAF)复合物内的子单元,用于同源 BAF53B(ACTL6B;612458)和BAF45B(DPF1;601670)有丝分裂后神经元中神经元特异性 BAF(nBAF)复合物内的子单元。npBAF复合物的子单元对于神经祖细胞增殖至关重要,编码其子单元的基因剂量减少的小鼠具有与人脊柱裂相似的神经管闭合缺陷。相比之下,BAF53B 和 nBAF 复合体对于有丝分裂后神经发育和树突形态发生的进化保守程序至关重要。Yoo et al.(2009)表明,这一重要转变是通过 miR9(从 miR9 茎环前体的另一臂加工而来的 miRNA)和 miR124(609327)抑制 BAF53A 介导的。他们发现 BAF53A 抑制是由 3-prime 非翻译区中的序列介导的,这些序列对应于 miR9 和 miR124 的识别位点,它们在有丝分裂后神经元中选择性表达。这些位点的突变导致 BAF53A 的持续表达和神经元中活性依赖性树突生长的缺陷。此外,神经祖细胞中 miR9 和 miR124 的过度表达导致增殖减少。前期研究表明miR9和miR124受到阻遏元件沉默转录因子(REST; 600571)。Yoo等人(2009)表明,有丝分裂后神经元中REST的表达导致BAF53A的去抑制,表明REST介导的microRNA抑制指导了染色质调节复合物的重要转换。
Yoo et al.(2011)证明,人成纤维细胞中miR9/9*和miR124的表达诱导其转化为神经元,这一过程由NEUROD2(601725)促进。进一步添加神经源性转录因子ASCL1(100790)和MYT1L(613084)增强了转化率和转化神经元的成熟,而没有上述microRNA的这些转录因子的表达是无效的。Yoo et al.(2011)得出结论,涉及miR9-1至miR9-3和miR124的遗传回路在神经命运决定中具有指导性作用。
核纤层蛋白A和C是LMNA基因(150330)的选择性剪接产物,是核纤层的关键组成部分。Jung et al.(2012)发现小鼠前核纤蛋白A和C的3-prime UTR均含有至少1个Mir9结合位点。Mir9 通过减少核纤层蛋白前体 A mRNA 下调核纤层蛋白 A 表达,但不下调核纤层蛋白 C 表达。研究结果表明,Mir9 的高表达导致小鼠大脑中核纤层蛋白 A 的含量相对于核纤层蛋白 C 的含量较低。
Cassidy et al.(2013)发现果蝇Mir9a通过下调转录因子“senseless”的表达,对原神经网络的基因表达产生广泛的缓冲作用(见600871)。
▼ 测绘
Gross(2007)根据成熟miRNA9序列(UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA)与基因组序列(build)的比对,将编码miRNA9的基因对应到染色体1(MIR9-1)、5(MIR9-2)和15(MIR9-3) 36.1)。
▼ 动物模型
Pedersen et al.(2013)报道,线虫微小RNA miR79是哺乳动物miR9的直系同源物,通过靶向蛋白聚糖生物合成途径中的两种蛋白质来控制糖链稳态:软骨素合酶(SQV5)和尿苷5-prime-di磷酸-糖转运蛋白(SQV7)。miR79 的缺失会通过表皮中的 SQV5 和 SQV7 失调导致神经发育缺陷。这会导致硫酸乙酰肝素生物合成部分关闭,从而影响 LON2/磷脂酰肌醇蛋白聚糖途径(参见 600395)并扰乱神经元迁移。Pedersen et al.(2013)得出的结论是,他们的结果确定了由保守的 microRNA 控制的调节轴,该轴维持细胞中的蛋白多糖稳态。