系统性红斑狼疮,易感性,12;SLEB12

细胞遗传学定位:8p23.1 基因组坐标(GRCh38):8:6,300,001-12,800,000
有关系统性红斑狼疮(SLE)的表型描述和遗传异质性的讨论,请参见 152700。

▼ 测绘

Hom et al.(2008)进行了一项全基因组关联研究,涉及来自 1,311 名 SLE 病例受试者和 1,783 名对照受试者的 DNA 样本中超过 500,000 个 SNP;所有受试者都是欧洲血统的北美人。在来自瑞典的 793 名病例受试者和 857 名对照受试者中进行了顶级基因座的复制。与对照相比,美国病例样本中染色体8p23.1单核苷酸多态性rs13277113的A等位基因高度富集(P = 8 x 10(-8);合并OR,1.39;95% CI,1.26-1.54)。在瑞典复制集中也观察到了相关性(P = 4 x 10(-4);或,1.33;95% CI,1.13-1.55)。rs13277113与美国和瑞典样本的联合分析显示P = 1 x 10(-10)。SNP rs13277113 对应到以相反方向转录的 2 个基因之间的间隔:BLK(191305)(Src 家族中的一种酪氨酸激酶,向 B 细胞受体下游发出信号)和 C8ORF13(FAM167A;610085)。rs13277113 的 A 等位基因纯合子的 BLK mRNA 表达水平约为 G 等位基因纯合子的 50%。C8ORF13基因的表达也与rs13277113 SNP相关,但方向相反。A 等位基因与 C8ORF13 的较高表达相关,而 G 等位基因与较低表达显着相关。A/G 杂合子的两个基因的表达水平处于中等水平。

Han 等人(2009)通过使用 Illumina-Human610-Quad BeadChips 对 1,047 例病例和 1,205 名对照进行基因分型,并在另外 2 个队列(3,152 例病例和 7,050 名对照)中复制 78 个 SNP,对中国汉族人群进行了 SLE 全基因组关联研究。Han et al.(2009)发现BLK基因与3个SNP存在关联。与rs7812879的相关性最强(综合P值=2.09 x 10(-24),比值比=0.69,95%置信区间0.64-0.74)。

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