内源性逆转录病毒 K 组,成员 5;ERVK-5
人内源性逆转录病毒 K II
HERV-KII
HGNC 批准的基因符号:ERVK-5
细胞遗传学定位:3cen-q13 基因组坐标(GRCh38):3:90,900,001-122,200,000
▼ 说明
人内源性逆转录病毒(HERV)是一种逆转录转座子,其 5 引物和 3 引物末端含有长末端重复序列(LTR),可编码病毒 env、gag 和 pol 蛋白。人类基因组中有30至50个HERV K组(HERV-K)基因,包括ERVK-5(Sugimoto et al., 2001总结)。
▼ 克隆与表达
Sugimoto et al.(2001)利用RT-PCR扩增正常人体组织和PA-1畸胎癌细胞株HERV-K序列的env区,然后筛选BAC文库,鉴定出ERVK-5,他们将其命名为HERV -KII。ERVK-5有潜力编码667个氨基酸的gag蛋白和截短的245个氨基酸的env蛋白,但其pol基因含有多个提前终止密码子。ERVK-5 表达低于 Northern 印迹分析检测的水平,但 RT-PCR 检测到肺、胎盘、睾丸、外周血白细胞和 PA-1 细胞中不同水平的 ERVK-5 表达。
▼ 基因功能
Sugimoto等人(2001)利用报告基因检测发现,ERVK-5的LTR在Tera-1和PA-1畸胎癌细胞中具有活性,而在NT2/D1畸胎癌细胞中活性低得多。
▼ 基因结构
Sugimoto等人(2001)确定ERVK-5含有共有TATA框,其LTR含有增强子核心序列和糖皮质激素反应元件。
▼ 测绘
Sugimoto等人(2001)利用辐射杂交和数据库分析将ERVK-5基因定位到染色体3cen-q13。