MIDASIN AAA ATPase 1; MDN1
MIDASIN 1
含 Midas 蛋白 1
HGNC 批准的基因符号:MDN1
细胞遗传学定位:6q15 基因组坐标(GRCh38):6:89,642,498-89,819,794(来自 NCBI)
▼ 说明
MDN1 是一种 AAA ATP 酶,可从核糖体 60S 子单元的不同前体中去除组装因子(Garbarino 和 Gibbons,2002;陈等人,2018)。
▼ 克隆与表达
Garbarino和Gibbons(2002)通过对人睾丸cDNA文库进行PCR克隆了MDN1。推导的 5,596 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 631 kD。来自不同生物体的 MDN1 蛋白的比较揭示了一个弱保守的 N 端结构域,随后是一个高度保守的 AAA 结构域(具有 6 个串联 AAA 原聚体)、一个接头结构域、一个中等保守的富含 asp/glu 的结构域和一个高度保守的 C 端M结构域含有金属离子依赖性粘附位点(MIDAS)基序。与其他 AAA 蛋白的比较表明,MDN1 和动力蛋白(见 600112)的 AAA 原体彼此之间的关系比 AAA 家族其他分支的关系更密切。内源酵母 Mdn1 主要定位于细胞核。
▼ 生化特征
Chen et al.(2018)提出了粟酒裂殖酵母 Mdn1 模型,表明 Mdn1 MIDAS 结构域通过富含 asp/glu 的柔性基序与 20 nm 长的结构连接结构域连接,该连接结构域连接到 AAA 环。对 Mdn1 中 6 个 AAA 结构域的检查表明,AAA5 有助于 Mdn1 的整体 ATP 酶活性,并且 ATP 酶位点在结构上不对称,并且可能异步运行。对 C 端底物结合 MIDAS 结构域的分析表明,MIDAS 结构域对接在 N 端 AAA 环上。在水解过程中,AAA环局部发生构象变化,这些局部变化通过直接接触直接传递到MIDAS结构域。这种构象动力学允许 Mdn1 从核糖体 60S 子单元的前体中解离组装因子,例如 Rsa4。
▼ 基因结构
Garbarino和Gibbons(2002)确定MDN1基因包含102个外显子,长度约为156 kb。
▼ 测绘
Garbarino and Gibbons(2002)通过基因组序列分析,将MDN1基因定位到染色体6q15。