具有立即反应蛋白 1 型 MOTIF 的解聚素样金属蛋白酶,6;ADAMTS6
HGNC 批准的基因符号:ADAMTS6
细胞遗传学定位:5q12.3 基因组坐标(GRCh38):5:65,148,738-65,481,920(来自 NCBI)
▼ 说明
ADAMTS6 是锌依赖性蛋白酶 ADAMTS 大家族的成员。有关 ADAMTS 基因家族的一般描述,请参见 ADAMTS1(605174)。
▼ 克隆与表达
Hurskainen等人(1999)通过使用人类ADAMTS1至ADAMTS4(603876)的蛋白质序列和线虫ADAMTS作为查询来搜索EST数据库,鉴定出ADAMTS5(605007)、ADAMTS6和ADAMTS7(605009)。他们分离出了包含完整 ADAMTS6 编码序列的 cDNA。预测的 860 个氨基酸 ADAMTS6 蛋白具有 ADAMTS 的结构域特征。从 N 末端开始,它有一个前原区,其中包含一个潜在的弗林蛋白酶切割位点和一个推定的半胱氨酸开关,一个催化结构域,包含一个典型的 Reprolysin 型锌结合特征和一个“met 转折”,一个解聚素-类似结构域、保守的 持续反应蛋白 模块、富含半胱氨酸的结构域、间隔结构域和第二个不太保守的 持续反应蛋白 模块。成熟的 ADAMTS6 蛋白有 2 个潜在的 N 连接糖基化位点。对几种人体组织的 Northern 印迹分析检测到大约 8.5 kb ADAMTS6 转录物,该转录物在胎盘中低水平表达,而在许多其他组织中几乎检测不到。Adamts6 在小鼠胚胎发育过程中未检测到表达。
Bevitt等人(2005)通过对ARPE19人视网膜色素上皮细胞的5-prime和3-prime RACE并筛选EST数据库,克隆了ADAMTS6的长剪接变体。推导的蛋白质包括 4 个潜在的 C 末端反应蛋白样重复序列和一个 PLAC 结构域。Northern 印迹分析在 ARPE19 细胞中检测到约 8.5 kb 的主要转录本。RT-PCR 分析检测到 ARPE19 细胞中的长剪接变异和短剪接变异。
▼ 基因功能
Bevitt et al.(2005)发现TNF-α(TNF; 191160)上调 ARPE19 细胞中 ADAMTS6 长变体和短变体的表达。
▼ 基因结构
Bevitt et al.(2005)确定ADAMTS6基因包含6个编码外显子。5-prime UTR 包含 11 个 AUG 密码子,其中 2 个位于 Kozak 共有序列内。
▼ 测绘
Hurskainen等(1999)通过体细胞杂交分析,将人类ADAMTS6基因定位到染色体5。
▼ 分子遗传学
Jorgenson 等人(2015)表明,ADAMTS6 在腹股沟疝易感位点的全基因组关联研究中对应到显着信号。该研究包括 5,295 例病例和 67,510 例对照,并在由 9,701 例病例和 82,743 例对照组成的孤立队列中得到证实。