CUB 和 SUSHI 多域 1；CSMD1

KIAA1890

HGNC 批准的基因符号：CSMD1

细胞遗传学定位：8p23.2 基因组坐标（GRCh38）：8:2,935,361-4,994,914（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Nagase 等人（2001）通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序，克隆了 CSMD1，并将其命名为 KIAA1890。推导的1,048个氨基酸的蛋白质与SEZ6L（607021）有33%的一致性。RT-PCR ELISA 检测到成人大脑、胎儿大脑、脊髓和所有受检查的单个成人大脑区域中的中间表达。在睾丸中检测到低表达，在检查的其他组织中检测到很少或没有表达。

Sun等人（2001）通过检查几个头颈鳞状细胞癌中缺失的染色体8p23区域，鉴定出了部分CSMD1序列。他们通过组装人脑和上呼吸消化道RNA获得了全长cDNA。推导的 3,508 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 383 kD。它具有一个包含信号肽的胞外 N 末端，随后是 14 个交替的 CUB 和 sushi 结构域、13 个额外的串联 sushi 结构域、一个跨膜区域和一个 63 个氨基酸的 C 端胞质尾，其中包含多个磷酸化位点。CUB 和 sushi 结构域通常具有多个 β 链结构，部分由 2 个保守的二硫键连接在一起。CSMD1 的 CUB 结构域与该模型不同，每个结构域仅包含 2 或 3 个半胱氨酸，而不是典型的 4 个半胱氨酸。Sun et al.（2001）还鉴定了一种罕见的选择性剪接转录本，该转录本缺少外显子 57 和 58，并编码计算出的 370-kD没有 sushi 结构域 22 和 23 的蛋白质。CSMD1 与 sushi Csmd1 具有 90% 的氨基酸同一性，后者在人类蛋白质的 sushi 结构域 16 和 17 之间包含一个额外的 sushi 元件。

Lau and Scholnick（2003）和Shimizu et al.（2003）指出CSMD1包含14个交替的CUB和sushi结构域，后面跟着14个额外的串联sushi结构域。

▼ 基因功能

Toomes等人（2003）确定CSMD1基因跨越了他们在7个口腔和口咽鳞状细胞癌细胞系中鉴定的染色体8p23中的3个非重叠纯合缺失区域中的2个。然而，进一步分析表明，CSMD1 基因的简单失活可能不是染色体 8p23 缺失的头颈癌肿瘤发展的基础。

Kraus等人（2006）发现大鼠Csmd1以与大鼠Crry相当的方式阻断经典补体途径激活，但它不阻断旁路途径激活。原位杂交和神经元免疫标记表明，Csmd1 在发育中的中枢神经系统和上皮组织中合成，特别是在神经生长锥中富集。Kraus等人（2006）提出CSMD1可能是发育中的中枢神经系统中补体激活和炎症的重要调节因子。

▼ 基因结构

Sun等人（2001）确定CSMD1基因包含69个外显子，跨度至少1 Mb。

▼ 测绘

Sun等人（2001）通过基因组序列分析，将CSMD1基因定位到几种头颈癌中缺失的染色体8p23区域。