通过与 T-SNARES 1A 相互作用进行囊泡运输;VTI1A

VTI1,酿酒酵母,A 的同源物

VTI1RP2

此条目中代表的其他实体:

包含 VTI1A/TCF7L2 融合基因

HGNC 批准的基因符号:VTI1A

细胞遗传学定位:10q25.2 基因组坐标(GRCh38):10:112,446,988-112,855,368(来自 NCBI)

▼ 说明

VTI1A是一种可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感融合蛋白附着蛋白(SNAP;参见 603215)受体(SNARE),在高尔基体和质膜之间的囊泡运输中发挥作用(Flowerdew and Burgoyne, 2009)。

▼ 克隆与表达

Xu et al.(1998)克隆了小鼠Vti1a,他们将其命名为Vti1rp2。推导的 217 个氨基酸蛋白具有 4 个假定的卷曲螺旋区域和一个 C 端跨膜结构域。最终的卷曲螺旋区域包括一个 ATP/GTP 结合基序 A(P 环)。Northern印迹分析在除睾丸之外的所有小鼠组织中检测到2.6-kb转录本,睾丸表达1.5-kb Vti1a转录本。蛋白质印迹分析和分级分离的大鼠肝膜的差异提取表明,Vti1a 是一种完整的高尔基体膜蛋白。

Flowerdew and Burgoyne(2009)通过对HeLa细胞进行免疫组织化学分析发现,人VTI1A呈点状囊泡分布。

▼ 基因功能

Xu et al.(1998)利用蛋白质下拉分析表明,小鼠Vti1a与α-SNAP(NAPA; 603215)。共免疫沉淀分析表明,Vti1a 与 2 个不同的 SNARE 复合物相互作用,其中包含突触融合蛋白-5(STX5;603189)或突触融合蛋白-6(STX6; 603944)。Vero猴肾细胞中Vti1a的免疫耗竭会干扰水泡性口炎病毒G蛋白(VSVG)的质膜运输,导致VSVG在高尔基体中积聚。

Flowerdew and Burgoyne(2009)表明钾通道相互作用蛋白-1(KCHIP1,或KCNIP1;604660)与通道形成Kv4.2钾通道子单元(KCND2; 605410),并且是 Kv4.2 运输至质膜所必需的。使用HeLa和小鼠Neuro2A神经母细胞瘤细胞,他们发现KCHIP1和Kv4.2使用包含VTI1A和VAMP7(300053)的细胞内囊泡运输途径,并且需要GTPase RAB1(179508),这与更传统的囊泡运输途径共享。VTI1A或VAMP7的敲低抑制Kv4.2和KCHIP1向质膜的转运,但对VSVG的膜转运没有影响。

▼ 细胞遗传学

VTI1A/TCF7L2融合基因

Bass等人(2011)报告了9名结直肠癌患者(114500)的全基因组测序,包括原发性结直肠肿瘤和匹配的邻近非肿瘤组织,平均覆盖率分别为30.7x和31.9x。他们发现每个肿瘤平均有 75 个体细胞重排,包括染色体对之间复杂的易位网络。11 种重排编码预测的框内融合蛋白,包括在 97 种结直肠癌中的 3 种中发现的 VTI1A 和 TCF7L2(602278)融合蛋白。虽然TCF7L2编码TCF4,在结直肠癌发生过程中与β-catenin(116806)协同作用,但融合蛋白缺乏TCF4 β-catenin结合域。Bass等人(2011)发现含有融合基因的结直肠癌细胞系依赖于VTI1A-TCF7L2,利用RNA干扰介导的敲低实现不依赖贴壁的生长。

▼ 测绘

Hartz(2011)根据VTI1A序列(GenBank BC017052)与基因组序列(GRCh37)的比对,将VTI1A基因定位到染色体10q25.2。

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