SUPRABASIN
SBSN
HGNC 批准的基因符号:SBSN
细胞遗传学定位:19q13.12 基因组坐标(GRCh38):19:35,523,367-35,528,311(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Park et al.(2002)通过消减杂交鉴定了分化的小鼠角质形成细胞中表达的基因,克隆了Sbsn。推导的 700 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 72 kD。Sbsn 包含一个 N 端跨膜结构域、一个含有富含甘氨酸、丙氨酸和组氨酸的短串联重复序列的中心结构域,以及几个磷酸化和肉豆蔻酰化位点。选择性剪接的转录物编码缺乏中央重复区域的蛋白质。Park等人(2002)通过皮肤RNA的RT-PCR克隆了部分人SBSN cDNA。对人体组织进行 Northern 印迹分析,在皮肤、食道、子宫、胸腺和角质形成细胞系中检测到 2.2-和 1.1-kb SBSN 转录物。Northern 印迹分析在小鼠胚胎第 15.5 天检测到 2 个 Sbsn 转录本,与表皮分层一致。胚胎和成年小鼠的原位杂交显示,舌、胃和表皮的上皮基底层上有 Sbsn 表达。成年小鼠组织的 Northern 和 RNA 斑点印迹分析显示,在子宫和甲状腺中表达,但在心脏、脑、脾、肺、肝、平滑肌和肾中不表达。荧光标记的 Sbsn 在转染的小鼠角质形成细胞中显示出点状细胞质分布,与溶酶体或线粒体标记不重叠。
Matsui et al.(2004)使用定量RT-PCR,在几个小鼠组织的复层上皮以及气管、膀胱和胸腺中检测到了Sbsn。在典型的单层上皮细胞中检测不到 Sbsn。小鼠足垫的原位杂交检测到整个棘层的 Sbsn 表达。表位标记的人 SBSN 在 293/EBNA-1 细胞中表达后进行 N 末端加工和分泌。
▼ 基因功能
Park et al.(2002)发现原代小鼠表皮角质形成细胞中Sbsn的表达受到钙和佛波酯的诱导,并受到PKC的抑制(参见PRKCA;176960)抑制剂。单体重组Sbsn通过转谷氨酰胺酶Tgm2(190196)和Tgm3(600238)交联成高分子量形式。Park et al.(2002)得出结论,SBSN可能在表皮分化中发挥作用。
Leclerc等(2014)发现皮肤因子(DMKN;DMKN;纯合子)新生小鼠皮肤中Krtdap(617212)和Sbsn的表达增加。617211)-β和-γ剪接变体。
▼ 基因结构
Park et al.(2002)确定小鼠Sbsn基因含有4个外显子。
▼ 测绘
Park et al.(2002)通过基因组序列分析,将SBSN基因定位到染色体19q13.1。他们将小鼠 Sbsn 基因定位到染色体 7B2-B3 的一个区域,该区域与人类染色体 19q13.1 具有同源性。
Matsui等人(2004)通过基因组序列分析,将SBSN基因定位到染色体19q13.1,与角蛋白相关基因KRTDAP和DMKN串联。