NOP2/SUN RNA 甲基转移酶家族,成员 5;NSUN5

NOP2/Sun DOMAIN 家族,成员 5

威廉斯-博伦综合征关键区域 20;WBSCR20

WBSCR20A

RCM1,酿酒酵母,同源物;RCM1

HGNC 批准的基因符号:NSUN5

细胞遗传学定位:7q11.23 基因组坐标(GRCh38):7:73,302,516-73,308,826(来自 NCBI)

▼ 说明

NSUN5 蛋白与增殖相关核仁蛋白 NOP2(164031)具有相似性。NSUN5 是威廉姆斯-博伊伦综合征(WBS;WBS;194050)(Doll 和 Grzeschik,2001)。NSUN5是RIGI(DDX58;609631)在限制RNA病毒感染中发挥作用的辅助受体(Sun et al., 2020)。

▼ 克隆与表达

Doll和Grzeschik(2001)通过数据库分析鉴定了WBS中缺失的染色体7的1.5-Mb区域中的基因,然后对成人胰腺cDNA文库和肝脏cDNA文库的5-prime RACE进行PCR,克隆了NSUN5,并将其转化为NSUN5。称为 WBSCR20。推导的 429 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 46.7 kD,并且具有 2 个与 NOP2 相似的结构域。序列分析揭示了一个高度相似的基因WBSCR20B(NSUN5P1),只是WBS缺失的端粒,预计与WBSCR20相比编码截短的蛋白质。Northern blot 分析检测到所有 8 个人体组织中 1.6-kb 和 1.7-kb 转录物的可变表达。作者预测对应于 WBSCR20 的较短转录本在骨骼肌中高度表达,而在胎盘中表达较弱。作者预测对应于 WBSCR20B 的较长变体在肾脏中高表达,在肝脏和胎盘中表达较弱。EST 数据库分析显示 WBSCR20 广泛表达。在小鼠和酿酒酵母中检测到 WBSCR20 的直系同源物,但在小鼠中不存在 WBSCR20B 的直系同源物。

Merla et al.(2002)确定全长WBSCR20A蛋白含有466个氨基酸。WBSCR20A 与 465 个氨基酸的探针蛋白有 84% 的同一性。Northern 印迹分析在所有 12 个人体组织中检测到 1.65 kb 和 5.0 kb WBSCR20A 转录本。RT-PCR 检测到大多数成人和胎儿组织中的表达。Merla et al.(2002)还鉴定了WBSCR20A基因的2个拷贝,WBSCR20B(NSUN5P1)和WBSCR20C(NSUN5P2),以及WBSCR20A的端粒和着丝粒。与全长 WBSCR20A 相比,两者都预计编码截短的蛋白质。EST 数据库分析和 RT-PCR 检测到这些拷贝在人体组织中的可变表达,尽管它们与全长 WBSCR20A 之间的表达模式不同。Merla et al.(2002)在啮齿类动物中仅鉴定出一个 Wbscr20 拷贝。

▼ 基因结构

Doll和Grzeschik(2001)确定NSUN5基因包含9个外显子,跨度5.6 kb。

Merla et al.(2002)指出NSUN5基因包含10个外显子。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Doll和Grzeschik(2001)将NSUN5基因定位到染色体7q11.23。他们将小鼠 Nsun5 基因定位到染色体 5G 的一个区域,该区域与人类染色体 7q11.23 具有同源性。人类中一个相关基因WBSCR20B(NSUN5P1)位于NSUN5的端粒,但不位于小鼠中。

Merla等人(2002)通过基因组序列分析,将NSUN5的2个拷贝的ORF截短的WBSCR20B(NSUN5P1)和WBSCR20C(NSUN5P2)、端粒和着丝粒分别定位到NSUN5。这些副本在啮齿动物中没有发现。

▼ 基因功能

Sun等人(2020)发现L929小鼠细胞中Nsun5的敲低通过减弱Rigi介导的抗病毒基因的转录来增强RNA病毒水泡性口炎病毒(VSV)的复制。进一步分析表明,Nsun5 增强了 Mavs(609676)上游的 Rigi 信号传导。因此,Nsun5缺陷导致RNA病毒感染后Tbk1(604834)和Irf3(603734)的磷酸化受到抑制以及Irf3的核转位,导致Rigi介导的信号转导受到抑制。免疫沉淀分析表明,Nsun5 与 Rigi 相互作用,Rigi 的 CARD 和 C 端结构域以及 Nsun5 的氨基酸 1 至 141 是相互作用所需的。通过与 Rigi 相互作用,Nsun5 充当辅助受体,促进 Rigi 感知病毒 RNA,因此在 Nsun5 缺陷细胞中,Rigi 与病毒 RNA 的结合受到损害。对 Nsun5 敲除小鼠的分析证实,Nsun5 对于宿主体内防御 RNA 病毒感染至关重要。

▼ 分子遗传学

Doll 和 Grzeschik(2001)利用体细胞杂交体(其中包括 3 个在染色体 7 的 WBS 关键区域内缺失的体细胞杂交体)证实 NSUN5 基因在 WBS 中被删除。

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