TCTEX1 域包含蛋白 2；TCTEX1D2
HGNC 批准基因符号：DYNLT2B
细胞遗传学定位：3q29 基因组坐标（GRCh38）：3:196,291,219-196,318,240（来自 NCBI）
▼ 说明
纤毛生长和信号传导依赖于驱动蛋白（参见 604683）依赖性顺行鞭毛内转运（IFT）和动力蛋白（参见 DYNC2H1, 603297）依赖性逆行 IFT。TCTEX1D2 作为轻链发挥作用，似乎可以稳定逆行 IFT 动力蛋白复合物（Schmidts et al., 2015）。
▼ 克隆与表达
Schmidts et al.（2015）报道，推导的142个氨基酸的TCTEX1D2蛋白具有C端TCTEX1（DYNLT1；601554）域名。数据库分析揭示了斑马鱼和衣藻中 TCTEX1D2 的直系同源物。
▼ 基因结构
Schmidts et al.（2015）确定TCTEX1D2基因有5个外显子。
▼ 测绘
Hartz（2017）根据TCTEX1D2序列（GenBank BC021177）与基因组序列（GRCh38）的比对，将TCTEX1D2基因定位到染色体3q29。
▼ 基因功能
Schmidts et al.（2015）发现人TCTEX1D2的衣藻直系同源物Tctex2b与D1bic1（WDR60；615462）、Tctex1以及基因丝内臂动力蛋白电机的几种IFT颗粒蛋白。衣藻中 Tctex2b 的缺失降低了逆行 IFT 速度和频率以及鞭毛组装速率，导致相对于野生型游动更慢。与野生型相比，孤立的 Tctex2b-null 鞭毛中参与逆行 IFT 的蛋白质含量降低，表明 Tctex2b 参与稳定逆行 IFT 动力蛋白复合物。对 HEK293T 细胞中与标记的 TCTEX1D2 共纯化的蛋白质进行质谱分析表明，TCTEX1D2 与 IFT 动力蛋白中间链 WDR34（613363）和 WDR60 以及轻链 DYNLT1、DYNLT3（300302）和 DYNLRB1（607167）相互作用。蛋白质下拉实验验证了 TCTEX1D2 与 WDR60 的直接相互作用。Schmidts et al.（2015）得出结论，TCTEX1D2是逆行IFT动力蛋白复合物的轻链，是复合物稳定所需的。
▼ 分子遗传学
土耳其家庭（UCL82）和法国家庭（INS）受影响儿童患有短肋胸廓发育不良（SRTD17；617405），Schmidts et al.（2015）鉴定了TCTEX1D2基因（617353.0001-617353.0003）功能丧失突变的纯合性或复合杂合性。在第三个家系（UCL4）中，3 个受影响的同胞是纯合子，删除了 TCTEX1D2 基因的起始密码子以及外显子 1 和 2，删除了超过 10 kb 的内容。此外，删除还删除了邻近的胰腺发育相关基因 TM4SF19 的外显子 2 至 5，作者表示该基因不太可能与 SRTD 相关。在 2 名明显未受影响的同胞中也检测到了该缺失，表明外显率降低。与对照组相比，UCL4 家族中受影响个体的皮肤成纤维细胞显示出纤毛细胞百分比显着降低。此外，在TCTEX1D2缺陷的成纤维细胞中，大约35%的纤毛尖端观察到IFT颗粒蛋白IFT88（600595）的显着积累，而对照成纤维细胞的这一比例不到10%，表明存在逆行IFT缺陷。
▼ 动物模型
Schmidts et al.（2015）利用反义吗啡啉发现，敲低斑马鱼Tctex1d2会导致剂量依赖性纤毛病表型，表现为体轴腹侧弯曲、脑积水、耳石异常和小眼睛。受精后存活至 4 天的少数胚胎表现出严重的全身水肿和前肾囊肿。突变胚胎的颅面软骨也有缺陷。受精后 2 至 4 天前肾管的免疫荧光分析显示突变斑马鱼的纤毛生长延迟。
▼ 等位基因变异体（3 Selected Examples）:
.0001 短肋胸廓发育不良 17 伴有多趾症
TCTEX1D2、IVS1DS、CG、+2
一名来自土耳其近亲家庭的5.5岁男孩（UCL82），患有短肋胸廓发育不良（SRTD17；617405），Schmidts et al.（2015）鉴定了TCTEX1D2基因内含子1中剪接位点突变（c.113+2C-G, NM_152773.4）的纯合性。对患者成纤维细胞 RNA 进行的 RT-PCR 未检测到 TCTEX1D2 转录本，表明无义介导的突变转录本衰变。该突变以杂合性形式存在于他未受影响的近亲父母中，并且在 dbSNP、1000 基因组计划或 EVC 数据库中未发现。
.0002 短肋胸廓发育不良 17 无多趾症
TCTEX1D2、ARG88TER
一名来自非近亲家庭（INS）的3岁法国男孩，患有短肋胸廓发育不良，不伴多指（SRTD17；617405），Schmidts et al.（2015）鉴定了 TCTEX1D2 基因外显子 3 中 c.262C-T 转换（c.262C-T, NM_152773.4）的复合杂合性，导致 arg88-to-ter（R88X） ）替换，以及外显子 1 中的删除/插入突变（c.100delinsCT），导致移码，预计会导致提前终止密码子（Val34LeufsTer12）。他未受影响的父母均具有 1 个突变杂合子，这两种突变均未在 dbSNP、1000 基因组计划或 EVC 数据库中发现。
.0003 短肋胸廓发育不良 17 不伴有多趾症
TCTEX1D2，删除/插入，100CT
讨论 TCTEX1D2 基因外显子 1 中的缺失/插入突变（c.100delinsCT, NM_152773.4），导致移码，预计会导致过早终止密码子（Val34LeufsTer12），该突变在 3- 复合杂合性中报告法国1岁男童短肋胸廓发育不良（SRTD17；Schmidts 等人（2015 年），参见 617353.0002。
