RAS 相关蛋白 RAB12;RAB12

HGNC 批准的基因符号:RAB12

细胞遗传学定位:18p11.22 基因组坐标(GRCh38):18:8,609,437-8,639,383(来自 NCBI)

▼ 说明

RAB GTPases(参见 179508),例如 RAB12,构成了一个蛋白质大家族,通过招募效应蛋白来控制膜身份并调节细胞内膜运输。RAB12 在质膜和跨高尔基体/跨高尔基体网络膜之间的逆行运输中发挥作用(Rydell et al., 2014)。

▼ 克隆与表达

Olkkonen等人(1993)通过筛选Madin-Darby犬肾(MDCK)细胞系,孤立出了编码Rab12的部分cDNA序列。小鼠组织的 Northern 印迹分析显示,肺和心脏中的表达最高,其次是脑、肾、脾和肝。在肠道中表达较低。仓鼠肾脏免疫荧光显微镜显示 Rab12 与高尔基体和非网格蛋白包被的蛋白质 Copb1(600959)共定位,表明 Rab12 可能参与生物合成/胞吐转运。

Rydell等人(2014)通过HeLa细胞的共聚焦显微镜发现,标记的RAB12主要表现为核周染色,还有一些囊泡染色。在外周区域,RAB12 与早期和再循环内体标记物共定位,在核周区域,它与脑池高尔基体标记物共分布。

▼ 基因功能

Yoshimura等人(2010)使用一组RAB GTPases进行体外GDP释放测定,发现DENND3(617503)对RAB12表现出高鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)活性。

Matsui et al.(2014)指出RAB12调节含有氨基酸转运蛋白PAT4(SLC6A4;SLC6A4;613760)从内体回收到溶酶体,其中 PAT4 被降解。通过这种方式,RAB12调节细胞内氨基酸浓度mTOR复合物(mTORC; 参见601231)活性和自噬。Matsui et al.(2014)表明,小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)中过表达小鼠 Dennd3 会增加 Pat4 的降解,降低细胞内 L-氨基酸浓度和 mTORC 活性,并增加自噬泡的产生。MEF 中 Dennd3 的敲低使 Rab12 失活,抑制 Pat4 降解,并升高细胞内 L-氨基酸浓度。然而,敲低 Dennd3 并不会提高 mTORC 活性或减少自噬通量,因为对 Akt(164730)途径具有竞争性、孤立于 Rab12 的作用,而 Akt(164730)途径往往会上调 mTORC 活性。

通过检查志贺毒素 B 子单元(STxB)诱导的肾小管膜内陷中的蛋白质并在细胞培养物中对氨基酸进行稳定同位素标记,Rydell 等人(2014)鉴定出了 RAB12。共聚焦显微镜证明 RAB12 在 STxB 诱导的肾小管膜内陷和 STxB 阳性囊泡上的定位。用小干扰 RNA 耗尽 RAB12 表明 RAB12 在功能上参与逆行 STxB 转运。RAB12的耗尽改变了TGN46(TGOLN2;603062)和阳离子非依赖性甘露糖6-磷酸受体(MPRI; 147280)不影响其他贩运路线。Rydell et al.(2014)得出结论,RAB12在逆行转运途径中发挥作用。

▼ 测绘

Gross(2015)根据RAB12序列(GenBank BC071600)与基因组序列(GRCh38)的比对,将RAB12基因定位到染色体18p11.22。

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