发育多能性相关基因 4;DPPA4
胚胎干细胞相关转录 15-1
ECAT15-1
HGNC 批准的基因符号:DPPA4
细胞遗传学定位:3q13.13 基因组坐标(GRCh38):3:109,326,144-109,339,636(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Masaki et al.(2007)通过扩增胚胎干(ES)细胞cDNA克隆了小鼠Dppa4。推导的 296 个氨基酸蛋白包含 N 端 SAP 结构域,计算分子量为 32.7 kD。Dppa4 与 小鼠 ES 细胞核中转录活性染色质标记共定位。蛋白质印迹分析在 小鼠 ES 细胞中检测到表观分子量为 42 kD 的 Dppa4,但在分化的 ES 细胞或 NIH3T3 成纤维细胞中未检测到。
Nakamura et al.(2011)利用定量RT-PCR发现Ecat15-1和Ecat15-2(DPPA4;DPPA4;614445)未分化小鼠胚胎干细胞含量较高。他们在胚胎第 12.5 天的野生型生殖嵴以及胚胎第 13.5 和 14.5 天的睾丸和卵巢中观察到低得多的表达。在成人睾丸中仅检测到微量的 Ecat15-1。在胚胎第 3.5 天的野生型小鼠囊胚中检测到 Ecat15-2 蛋白。
▼ 基因功能
Masaki et al.(2007)发现,小鼠Dppa4的过度表达抑制小鼠ES细胞的分化和分化ES细胞的增殖。相反,在没有其他诱导剂的情况下,抑制 Dppa4 表达会诱导 ES 细胞分化为原始外胚层谱系。
SOX2(184429)和OCT3/4(POU5F1;164177)协同结合含有HMG/POU框的DNA调控区,并作为胚胎发生的主调控因子。Chakravarthy et al.(2008)发现小鼠和人DPPA4基因的5-prime区域含有HMG/POU框。染色质免疫沉淀和迁移率变化测定证实,DPPA4 是人和小鼠 ES 细胞以及小鼠胚胎癌细胞中 SOX2 和 OCT3/4 的靶标。
Nakamura et al.(2011)表明Ecat15-1和Ecat15-2在小鼠胚胎干细胞的细胞核中形成复合物相互作用并与靶基因结合。
▼ 基因结构
Du et al.(2004) determined that the DPPA2 gene contains 9 exons.
▼ 测绘
Hartz(2011)根据DPPA4序列(GenBank AK001575)与基因组序列(GRCh37)的比对,将DPPA4基因定位到染色体3q13.13。
Nakamura et al.(2011)指出,在染色体16上,探针Dppa2和Dppa4基因相距约17 kb。
▼ 动物模型
Nakamura等人(2011)创建了Ecat15-1或Ecat15-2单敲除小鼠和同时缺乏Ecat15-1和Ecat15-2的双敲除小鼠。所有突变小鼠均因呼吸衰竭而围产期死亡率升高,其中一些肺部异常明显。Ecat15-1 -/- 和双敲除 Ecat15-1 -/- Ecat15-2 -/- 表型不如 Ecat15-2 -/- 小鼠严重,导致没有新生儿存活到断奶。那些幸存的 Ecat15-1 -/- 和 Ecat15-1 -/- Ecat15-2 -/- 小鼠具有生育能力。在胚胎 12.5 至 14.5 天之间的野生型肺或成人肺中未检测到 Ecat15 mRNA 或蛋白质。然而,微阵列分析显示,Ecat15 突变胚胎干细胞和 Ecat15 突变肺中几种发育相关转录因子的异常表达。Ecat15-2 -/- 胚胎干细胞的表观遗传状态检查显示 Syce1(611486)、Gata4(600576)和 Nkx2-5(600584)启动子高度甲基化。Nakamura et al.(2011)得出的结论是,Ecat15复合物在小鼠胚胎干细胞和植入前胚胎中是可有可无的,但它提供了随后肺正常发育所需的表观遗传变化。