含有三联基序的蛋白质 62; TRIM62
导管上皮相关环蛋白,染色体 1; DEAR1
HGNC 批准的基因符号:TRIM62
细胞遗传学定位:1p35.1 基因组坐标(GRCh38):1:33,145,399-33,182,043(来自 NCBI)
▼ 说明
TRIM62属于RING-B框-卷曲-卷曲(RBCC)/三联基序(TRIM)蛋白家族,参与分化、发育和肿瘤发生(Lott et al., 2009)。TRIM62 具有泛素连接酶的功能(Cao et al., 2015)。
▼ 克隆与表达
Lott等人(2009)通过抑制消减杂交克隆,然后筛选神经上皮细胞cDNA文库和胎盘RNA的RT-PCR,克隆了TRIM62,他们将其命名为DEAR1。预测的 475 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 54 kD,与其啮齿动物直系同源物具有 98% 的同一性。DEAR1 在其 N 端和中心区域包含 RBCC/TRIM 蛋白的典型基序,在其 C 端具有 PRY 和 SPRY 结构域。Northern 印迹分析检测到所有检查的人体组织中 4.4 kb 转录物的可变表达。其他较小的转录本在一些组织中表达,包括心脏、胎盘、骨骼肌和大脑。Western blot 分析证实了 DEAR1 蛋白的普遍表达。免疫组织化学分析显示 DEAR1 表达定位于导管和腺上皮。
▼ 基因结构
Lott et al.(2009)确定TRIM62基因含有5个外显子。
▼ 测绘
Lott et al.(2009)利用FISH和生物信息学分析将DEAR1基因定位到染色体1p35.1。
▼ 基因功能
DEAR1 对应到染色体 1 的一个区域,该区域经常与乳腺癌杂合性丧失相关(114480)。Lott et al.(2009)发现DEAR1的表达在乳腺癌细胞系中下调,并转变为原位导管癌,这是乳腺癌肿瘤发生的早期组织学阶段。他们在乳腺癌细胞系和肿瘤中发现了 DEAR1 的错义突变和缺失。插入野生型 DEAR1 可恢复具有 DEAR1 突变的培养乳腺癌细胞的正常形态。乳腺上皮细胞中 DEAR1 的敲除再现了含有 DEAR1 突变的乳腺癌细胞系的表型。DEAR1表达缺失与孕激素受体(PGR;607311)表达并具有三阴性表型(即ER阴性(ESR1; 133430)、PGR、HER2(ERBB2;164870))乳腺癌。DEAR1 的表达孤立预测早发性乳腺癌的局部无复发生存率。Lott et al.(2009)得出结论,DEAR1表达缺失是早期乳腺癌的一个孤立的预后标志。
Cao et al.(2015)利用多种方法证明TRIM62在小鼠和人体内结合CARD9(607212)的C端。CARD9 缺乏外显子 11,该外显子与预防炎症性肠病(IBD;见266600),没有绑定TRIM62。免疫荧光显微镜证明 TRIM62 与野生型 CARD9 在小鼠和人类细胞中共定位。免疫沉淀分析表明 TRIM62 通过 lys27 连接泛素化 CARD9。
▼ 动物模型
Cao et al.(2015)发现,Trim63 -/- 小鼠在应对热灭活的白色念珠菌时,促炎通路激活受损,并且在活白色念珠菌后,肾脏、脾脏和肝脏中的菌落增加,死亡率增加感染。与 Card9 -/- 小鼠类似,Trim62 -/- 小鼠也更容易受到葡聚糖硫酸钠诱导的结肠炎的影响。Cao et al.(2015)得出结论,TRIM62是一种泛素连接酶,调节CARD9介导的抗真菌免疫和肠道炎症。